157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2742 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  100 
 
 		 348 aa  716    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  91.95 
 
 		 348 aa  667    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  73.33 
 
 		 347 aa  507  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  57.73 
 
 		 347 aa  424  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  59.82 
 
 		 342 aa  418  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  59.71 
 
 		 349 aa  420  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  56.56 
 
 		 349 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  58.94 
 
 		 350 aa  414  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  58.72 
 
 		 346 aa  409  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  56.94 
 
 		 349 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  57.35 
 
 		 349 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  58.38 
 
 		 348 aa  404  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  55.52 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  57.35 
 
 		 352 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  57.43 
 
 		 347 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  56.72 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  52.03 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  51.75 
 
 		 353 aa  352  5e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  52.34 
 
 		 639 aa  351  1e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  51.8 
 
 		 365 aa  348  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  50.88 
 
 		 624 aa  344  1e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  48.39 
 
 		 640 aa  335  5e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  49.71 
 
 		 348 aa  332  5e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  46.82 
 
 		 631 aa  315  7e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  47.01 
 
 		 334 aa  311  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  45.99 
 
 		 351 aa  308  1.0000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  45.77 
 
 		 346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  46.04 
 
 		 343 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  41.35 
 
 		 346 aa  276  4e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  41.06 
 
 		 347 aa  275  7e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  42.31 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  43.27 
 
 		 346 aa  263  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  39.47 
 
 		 341 aa  255  8e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  42.52 
 
 		 343 aa  252  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  42.52 
 
 		 343 aa  252  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  43.36 
 
 		 344 aa  252  8.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  41.89 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  39.73 
 
 		 368 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  41.11 
 
 		 344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  41.89 
 
 		 343 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  37.7 
 
 		 369 aa  245  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  42.18 
 
 		 351 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  38.7 
 
 		 358 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  40 
 
 		 369 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  38.77 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  38.92 
 
 		 368 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  36.74 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  42.15 
 
 		 332 aa  240  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  36.74 
 
 		 371 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  36.74 
 
 		 371 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  41.83 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  44.16 
 
 		 365 aa  239  5.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  37.09 
 
 		 365 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  37.03 
 
 		 368 aa  237  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  41.4 
 
 		 350 aa  236  6e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  41 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  36.54 
 
 		 368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  38.37 
 
 		 350 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  37.6 
 
 		 371 aa  233  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  39.59 
 
 		 340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  41.59 
 
 		 355 aa  233  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  39.13 
 
 		 346 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  36.78 
 
 		 370 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  36.51 
 
 		 370 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  37.02 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  39.67 
 
 		 374 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  36.14 
 
 		 375 aa  230  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.64 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  37.3 
 
 		 368 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  36.24 
 
 		 370 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  36.84 
 
 		 370 aa  229  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  37.03 
 
 		 368 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  36.29 
 
 		 370 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  38.11 
 
 		 368 aa  228  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  35.97 
 
 		 370 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  35.97 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  36.49 
 
 		 368 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  36.49 
 
 		 368 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  36.01 
 
 		 370 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  37.03 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  35.73 
 
 		 370 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  37.26 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  35.73 
 
 		 370 aa  225  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  35.95 
 
 		 368 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  40 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  40.36 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  36.36 
 
 		 370 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  34.71 
 
 		 364 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  35.71 
 
 		 367 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  37.03 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  35.16 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  36.73 
 
 		 363 aa  219  7e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  39.12 
 
 		 341 aa  218  8.999999999999998e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  35.95 
 
 		 348 aa  218  8.999999999999998e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  36.28 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  39.42 
 
 		 340 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  35.54 
 
 		 365 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  39.62 
 
 		 383 aa  216  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1849  agmatine deiminase  35.65 
 
 		 369 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552976  decreased coverage  0.00228426 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  41.18 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>