More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4353 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 290 aa  577  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  84.78 
 
 		 230 aa  374  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  55.02 
 
 		 229 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  49.52 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  52.94 
 
 		 215 aa  188  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 214 aa  178  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 217 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2296  GntR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 216 aa  163  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1244  GntR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 227 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 218 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4210  GntR family transcriptional regulator  44.65 
 
 		 229 aa  145  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 211 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  40.91 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3944  GntR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  39.9 
 
 		 216 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0287  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 242 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 229 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  42.27 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  37.75 
 
 		 239 aa  125  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2389  putative transcriptional regulator  43.07 
 
 		 213 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2570  transcriptional regulator  40.95 
 
 		 213 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.565298  hitchhiker  0.000000111966 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 225 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 219 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  38.69 
 
 		 233 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  40.7 
 
 		 237 aa  119  7.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 233 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 230 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 235 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 227 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 222 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 253 aa  115  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 235 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 234 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 215 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 215 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 239 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 239 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 228 aa  112  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 228 aa  112  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 232 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  36.82 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 239 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 233 aa  109  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 222 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 226 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  38.62 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  35.1 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  37 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 233 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 240 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 220 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 227 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 244 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 232 aa  106  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  38.3 
 
 		 222 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 228 aa  105  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  34.7 
 
 		 238 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 240 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 234 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  36.55 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  39.37 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2481  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 218 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>