More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2184 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 263 aa  525  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  44.19 
 
 		 256 aa  238  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  46.09 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  46.09 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  46.09 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  46.09 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  46.48 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  46.09 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  46.09 
 
 		 255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  44.92 
 
 		 255 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  44.57 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  45.7 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  44.92 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  45.7 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  40.93 
 
 		 262 aa  229  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  45.8 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0265  hydrolase, TatD family  41.47 
 
 		 253 aa  226  4e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0321314  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  42.25 
 
 		 253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0541  hydrolase, TatD family  43.02 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000604201 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  43.24 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2415  hypothetical protein  41.47 
 
 		 255 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000025534  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  44.06 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  44.06 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1278  TatD family hydrolase  40.7 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  44.44 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  45.98 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02785  Sec-independent protein translocase protein TatD  41.09 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  44.53 
 
 		 259 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  42.86 
 
 		 462 aa  218  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00569  deoxyribonuclease  42.64 
 
 		 254 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  42.08 
 
 		 257 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  41.92 
 
 		 257 aa  218  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  43.46 
 
 		 458 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3003  TatD related DNase  40.31 
 
 		 265 aa  216  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0100671  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  45.21 
 
 		 260 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  43.13 
 
 		 458 aa  214  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  42.8 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  44.4 
 
 		 606 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1922  hypothetical protein  39.92 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  43.58 
 
 		 462 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  40.54 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  40.15 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  39.45 
 
 		 255 aa  208  8e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  40.08 
 
 		 256 aa  208  9e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  41.92 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  39.15 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  42.8 
 
 		 256 aa  206  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  44.79 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  38.7 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  40.86 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  44.02 
 
 		 270 aa  205  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  40.15 
 
 		 461 aa  204  9e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  40.31 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  42.91 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  39.69 
 
 		 464 aa  203  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  42.97 
 
 		 263 aa  202  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  44.02 
 
 		 265 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  40.38 
 
 		 257 aa  203  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  38.49 
 
 		 457 aa  202  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  44.36 
 
 		 264 aa  202  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  45.21 
 
 		 258 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  41.8 
 
 		 267 aa  201  8e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  39.85 
 
 		 258 aa  201  8e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  42.58 
 
 		 269 aa  201  9e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  45.59 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  43.36 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_805  hydrolase, TatD family, Mg-dependent DNase  43.68 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  40.62 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  40.86 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  39.53 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  40.7 
 
 		 459 aa  199  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  38.37 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  41.63 
 
 		 258 aa  199  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  44.87 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  44.4 
 
 		 256 aa  199  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  41.92 
 
 		 263 aa  199  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  40.62 
 
 		 263 aa  198  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  35.5 
 
 		 256 aa  198  7.999999999999999e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  39.46 
 
 		 251 aa  198  9e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  41.54 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  45.21 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2173  Sec-independent protein translocase TatD  37.84 
 
 		 261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.69531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  42.19 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  42.97 
 
 		 264 aa  195  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  42.97 
 
 		 259 aa  195  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  38.37 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  41.41 
 
 		 264 aa  195  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  42.47 
 
 		 261 aa  195  6e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  42.58 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  40.3 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  40.61 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  41.2 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  40.23 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  40.75 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  38.76 
 
 		 271 aa  192  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  37.89 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  43.8 
 
 		 270 aa  192  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  41.09 
 
 		 264 aa  191  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  38.61 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  41.57 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>