239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2076 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
419 aa  814  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  61.39 
 
 
421 aa  483  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  59.19 
 
 
420 aa  461  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  53.68 
 
 
425 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6584  major facilitator superfamily MFS_1  59.4 
 
 
420 aa  425  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2822  major facilitator superfamily MFS_1  54.24 
 
 
415 aa  408  1e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2947  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 
432 aa  352  6e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1434  major facilitator transporter  50.36 
 
 
432 aa  352  9e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1407  major facilitator transporter  49.29 
 
 
447 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1398  major facilitator transporter  50.12 
 
 
432 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1218  Fucose permease-like protein  93.81 
 
 
158 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  31.33 
 
 
424 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  32.28 
 
 
435 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  31.91 
 
 
423 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  31.91 
 
 
423 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  32.06 
 
 
424 aa  156  5e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  33.85 
 
 
415 aa  156  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  33.85 
 
 
415 aa  156  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  30.67 
 
 
423 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  30.67 
 
 
423 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  30.67 
 
 
423 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  30.67 
 
 
423 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  30.67 
 
 
423 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  32.41 
 
 
423 aa  152  9e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  28.71 
 
 
436 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  29.79 
 
 
435 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  31.16 
 
 
431 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  8.54879e-05  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  31.91 
 
 
431 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  30.9 
 
 
431 aa  147  2e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  30.58 
 
 
415 aa  147  4e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  30.2 
 
 
426 aa  146  6e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  29.76 
 
 
428 aa  142  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  29.7 
 
 
426 aa  142  9e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  29.22 
 
 
435 aa  140  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  29.29 
 
 
428 aa  139  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  30.62 
 
 
421 aa  139  9e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  30.21 
 
 
421 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  29.87 
 
 
428 aa  136  6e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  26.67 
 
 
440 aa  135  1e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  31.47 
 
 
427 aa  133  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  28.61 
 
 
410 aa  132  1e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  28.98 
 
 
407 aa  132  1e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  28.71 
 
 
420 aa  131  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  30.1 
 
 
429 aa  130  5e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  29.29 
 
 
437 aa  130  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  30.35 
 
 
389 aa  126  8e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  27.47 
 
 
439 aa  124  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  27.04 
 
 
412 aa  123  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  27.21 
 
 
428 aa  122  2e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  30.05 
 
 
405 aa  118  2e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  32.11 
 
 
426 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  28.09 
 
 
425 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  26.88 
 
 
417 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  27.58 
 
 
412 aa  111  2e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  28.22 
 
 
406 aa  112  2e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  28.47 
 
 
413 aa  110  4e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  26.48 
 
 
458 aa  110  4e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  30.99 
 
 
429 aa  109  7e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  26.83 
 
 
431 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  27.41 
 
 
417 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  26.38 
 
 
408 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  4.42276e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  26.62 
 
 
408 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  28.4 
 
 
403 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  29.72 
 
 
413 aa  107  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  28.57 
 
 
440 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  29.35 
 
 
407 aa  106  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  26.4 
 
 
432 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  28.16 
 
 
441 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  27.15 
 
 
415 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  27.55 
 
 
438 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0222  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 
388 aa  101  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.153836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  24.73 
 
 
431 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  27.25 
 
 
429 aa  100  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  27.01 
 
 
429 aa  100  6e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2170  sugar transporter  26.83 
 
 
429 aa  99.8  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  26.59 
 
 
436 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30 
 
 
438 aa  97.8  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  27.96 
 
 
431 aa  97.8  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  29.32 
 
 
452 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.68 
 
 
443 aa  97.8  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  29.32 
 
 
452 aa  96.7  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  27.61 
 
 
408 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1052  L-fucose permease  23.65 
 
 
444 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682471  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  27.46 
 
 
431 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  26.43 
 
 
433 aa  92.8  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  27.11 
 
 
419 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  26.36 
 
 
468 aa  91.7  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  26.03 
 
 
407 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.23123e-10  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  25.62 
 
 
468 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  27.12 
 
 
444 aa  91.3  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  25.74 
 
 
417 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.71 
 
 
441 aa  90.9  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0849  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 
430 aa  90.5  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  28.3 
 
 
429 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  26.62 
 
 
438 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  26.62 
 
 
438 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  26.62 
 
 
438 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  26.62 
 
 
438 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  27.76 
 
 
411 aa  90.1  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  29.15 
 
 
452 aa  89  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>