More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4787 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
387 aa  784    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  77.32 
 
 
388 aa  616  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  76.55 
 
 
388 aa  611  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  75.77 
 
 
389 aa  605  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  75.52 
 
 
389 aa  598  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  76.8 
 
 
388 aa  595  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  72.38 
 
 
391 aa  586  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  70.69 
 
 
391 aa  569  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  71.58 
 
 
382 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  69.51 
 
 
382 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  69.51 
 
 
382 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  67.78 
 
 
390 aa  540  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  71.39 
 
 
385 aa  533  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  69.51 
 
 
382 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  69.04 
 
 
395 aa  518  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  56.96 
 
 
383 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  47.69 
 
 
389 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  44.59 
 
 
385 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  43.88 
 
 
383 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  41.41 
 
 
390 aa  262  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  45.57 
 
 
393 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  46.67 
 
 
390 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  44.01 
 
 
402 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  48.02 
 
 
384 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  43.49 
 
 
402 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  43.61 
 
 
383 aa  249  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  44.01 
 
 
403 aa  249  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  43.41 
 
 
383 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  43.12 
 
 
383 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  42.33 
 
 
383 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  43.3 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  40.51 
 
 
380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  41.54 
 
 
383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  44.1 
 
 
382 aa  243  6e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  40.81 
 
 
388 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  43.19 
 
 
381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  40.67 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  40.16 
 
 
379 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  39.62 
 
 
379 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  40.36 
 
 
384 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  38.99 
 
 
390 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  39.62 
 
 
379 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  39.08 
 
 
379 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  43.01 
 
 
382 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  40.65 
 
 
379 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  42.53 
 
 
384 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  40.33 
 
 
380 aa  206  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  40.27 
 
 
388 aa  193  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  35.45 
 
 
402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  35.45 
 
 
402 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  35.45 
 
 
402 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  33.41 
 
 
403 aa  187  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  38.33 
 
 
394 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  42.31 
 
 
389 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
390 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  33.68 
 
 
388 aa  172  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  33.93 
 
 
394 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  34.57 
 
 
402 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.11 
 
 
387 aa  169  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  34.53 
 
 
387 aa  167  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  34.95 
 
 
404 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  33.7 
 
 
390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.62 
 
 
397 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  35.54 
 
 
378 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  36.11 
 
 
381 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  33.24 
 
 
388 aa  160  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.05 
 
 
385 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  34.16 
 
 
386 aa  160  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  33.84 
 
 
387 aa  159  7e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  34.1 
 
 
404 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  34.86 
 
 
386 aa  159  9e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  36.47 
 
 
389 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  32.6 
 
 
395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  36.34 
 
 
391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  35.05 
 
 
389 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.44 
 
 
385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.011821 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0855  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-10)  31.32 
 
 
385 aa  154  4e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0722065  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  35.16 
 
 
394 aa  153  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.59 
 
 
389 aa  153  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2377  hypothetical protein  33.58 
 
 
402 aa  153  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494222  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0316  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-6)  32.43 
 
 
380 aa  152  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.51 
 
 
387 aa  152  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3952  putative thiolase  35.62 
 
 
378 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.130005  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  33.63 
 
 
386 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  33.94 
 
 
388 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  33.94 
 
 
388 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  33.94 
 
 
388 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  32.11 
 
 
396 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  34.16 
 
 
390 aa  150  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  31.17 
 
 
392 aa  149  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.01 
 
 
389 aa  149  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  31.48 
 
 
388 aa  149  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  36.86 
 
 
390 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  37.12 
 
 
385 aa  149  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.68 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  35.14 
 
 
389 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  35.2 
 
 
396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  31.23 
 
 
387 aa  145  9e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  31.61 
 
 
390 aa  145  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.61 
 
 
384 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>