More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3797 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 329 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  81.46 
 
 		 329 aa  544  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  75.08 
 
 		 336 aa  488  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  70.9 
 
 		 339 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1578  hypothetical protein  70.64 
 
 		 395 aa  470  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383459 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  68.79 
 
 		 331 aa  463  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  68.2 
 
 		 335 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  67.17 
 
 		 331 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3271  hypothetical protein  73.53 
 
 		 338 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  60 
 
 		 330 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  58.72 
 
 		 332 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  47.89 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  46.18 
 
 		 339 aa  275  9e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  46.41 
 
 		 334 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41.21 
 
 		 330 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.33 
 
 		 330 aa  258  7e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  41.75 
 
 		 360 aa  258  9e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  41.44 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  44.04 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  40.43 
 
 		 322 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  43.52 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  42.81 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.86 
 
 		 339 aa  252  7e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  43.89 
 
 		 324 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  41.58 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  44.06 
 
 		 324 aa  250  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  39.58 
 
 		 339 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  40.24 
 
 		 344 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  45.15 
 
 		 322 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  42.81 
 
 		 333 aa  248  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  42.57 
 
 		 324 aa  248  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1601  hypothetical protein  42.72 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0236612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.3 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  43.16 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1120  hypothetical protein  41.81 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.432341 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  44.48 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  40.99 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  44.82 
 
 		 323 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  41.36 
 
 		 339 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  40.88 
 
 		 322 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  43.65 
 
 		 356 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  43.41 
 
 		 336 aa  245  6.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.65 
 
 		 345 aa  245  9e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  44.25 
 
 		 355 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.65 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.56 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2834  hypothetical protein  41.67 
 
 		 327 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421115  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  41.22 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  40.56 
 
 		 324 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  44.6 
 
 		 314 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  41.34 
 
 		 335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  42.86 
 
 		 335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.11 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  41.54 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.19 
 
 		 328 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  41.51 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  44.9 
 
 		 325 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  39.01 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.02 
 
 		 327 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  43 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  41.51 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  39.74 
 
 		 337 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  40.87 
 
 		 334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.78 
 
 		 328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  42.28 
 
 		 317 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.8 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.51 
 
 		 331 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  43.92 
 
 		 334 aa  239  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0972  hypothetical protein  41.36 
 
 		 320 aa  239  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0157499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.53 
 
 		 330 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  41.45 
 
 		 329 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.95 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  37.5 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  41.56 
 
 		 323 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  44.19 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  41.32 
 
 		 698 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  41.95 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0252  hypothetical protein  40.24 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  39.38 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  42.27 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  40.86 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  42.81 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  40.94 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  39.39 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.47 
 
 		 339 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  40.25 
 
 		 325 aa  237  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  41.72 
 
 		 353 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  40.32 
 
 		 331 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  37.54 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  40.32 
 
 		 331 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  43.29 
 
 		 328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  43.14 
 
 		 337 aa  235  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  40.25 
 
 		 329 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  40.07 
 
 		 330 aa  236  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  44.14 
 
 		 335 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  41.16 
 
 		 330 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  41.87 
 
 		 327 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1715  hypothetical protein  41.25 
 
 		 320 aa  235  7e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  40.07 
 
 		 349 aa  235  7e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>