More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2359 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  100 
 
 		 425 aa  852    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  86.85 
 
 		 403 aa  719    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  63.9 
 
 		 410 aa  523  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  63.7 
 
 		 414 aa  518  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  63.24 
 
 		 407 aa  513  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  59.56 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  59.85 
 
 		 406 aa  480  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  60.2 
 
 		 405 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  60.2 
 
 		 405 aa  476  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  60.49 
 
 		 413 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  59.85 
 
 		 412 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  59.85 
 
 		 408 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  57.78 
 
 		 430 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  59.3 
 
 		 407 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  53.94 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  53.94 
 
 		 402 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  52.44 
 
 		 402 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  52.82 
 
 		 402 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  50.26 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  53.44 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  53.94 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  53.06 
 
 		 406 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  49.38 
 
 		 410 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  52.13 
 
 		 408 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  49.63 
 
 		 410 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  53.3 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  48.77 
 
 		 410 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  48.77 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  49.13 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  49.13 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  49.38 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  52.43 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  54.7 
 
 		 401 aa  363  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  51.66 
 
 		 399 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  47.77 
 
 		 405 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  51.44 
 
 		 408 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  50.77 
 
 		 480 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  45.12 
 
 		 404 aa  348  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  50.92 
 
 		 410 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  46.84 
 
 		 412 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 406 aa  342  5e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  49.62 
 
 		 405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  42.49 
 
 		 414 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  49.87 
 
 		 405 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  45.29 
 
 		 412 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  43.88 
 
 		 404 aa  333  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  43.19 
 
 		 404 aa  324  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 417 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  43.69 
 
 		 411 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  43.5 
 
 		 411 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  44 
 
 		 411 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  44.67 
 
 		 413 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  43.53 
 
 		 409 aa  311  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  42.43 
 
 		 409 aa  305  7e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  41.57 
 
 		 416 aa  297  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  38.69 
 
 		 412 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  38.69 
 
 		 412 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  41.19 
 
 		 528 aa  288  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  39.41 
 
 		 421 aa  286  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 414 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 412 aa  281  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 415 aa  272  7e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  41.89 
 
 		 417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  41.89 
 
 		 417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  41.89 
 
 		 417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  41.89 
 
 		 417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  41.89 
 
 		 417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  41.89 
 
 		 417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 405 aa  266  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  43.3 
 
 		 398 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  36.84 
 
 		 411 aa  258  9e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 403 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  38.3 
 
 		 415 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 427 aa  223  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  39.23 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  36.75 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  38.22 
 
 		 411 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  35.54 
 
 		 421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 452 aa  137  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  27.57 
 
 		 452 aa  136  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 422 aa  127  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 438 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 442 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 431 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  25.46 
 
 		 429 aa  104  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  29.02 
 
 		 425 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  27.54 
 
 		 435 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>