More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1797 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  100 
 
 		 389 aa  749    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  68.81 
 
 		 411 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  52.2 
 
 		 411 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  52.58 
 
 		 413 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  51.94 
 
 		 411 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  51.16 
 
 		 411 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  41.6 
 
 		 402 aa  246  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  39.69 
 
 		 416 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  37.89 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  37.27 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  39.17 
 
 		 528 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 417 aa  236  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  37.89 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  37.53 
 
 		 405 aa  234  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 405 aa  234  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 414 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  39.73 
 
 		 416 aa  233  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 406 aa  232  9e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  37.43 
 
 		 413 aa  229  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 		 405 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  36.73 
 
 		 407 aa  226  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  39.19 
 
 		 425 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  38.78 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  38.78 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  36.77 
 
 		 400 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  37.6 
 
 		 400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  40.17 
 
 		 414 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  39.17 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  39.17 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  39.17 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  39.17 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  39.17 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  39.17 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  39.17 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 404 aa  220  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 		 407 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 412 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 400 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  37.66 
 
 		 430 aa  215  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  34.96 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  36.77 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 414 aa  213  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  34.59 
 
 		 414 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  36.77 
 
 		 402 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 415 aa  210  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  37.18 
 
 		 409 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 402 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  38.29 
 
 		 399 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 410 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 409 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  38.16 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  32.88 
 
 		 404 aa  204  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 404 aa  203  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  34.82 
 
 		 417 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  37.23 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  33.42 
 
 		 421 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  36.98 
 
 		 410 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 412 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 436 aa  199  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  36.22 
 
 		 402 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 412 aa  196  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  36.58 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 410 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  36.55 
 
 		 410 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  36.55 
 
 		 410 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  35.95 
 
 		 480 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 410 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  35.03 
 
 		 412 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 403 aa  179  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  32.5 
 
 		 411 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  31.99 
 
 		 421 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 		 405 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  35.09 
 
 		 405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 442 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 422 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 457 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  28.93 
 
 		 429 aa  100  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  29.2 
 
 		 430 aa  100  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 438 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 452 aa  99.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  29.12 
 
 		 435 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 436 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  25.67 
 
 		 452 aa  91.3  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 433 aa  90.5  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 427 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 418 aa  90.5  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 427 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>