More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0847 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  664    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  90.85 
 
 		 335 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3791  hypothetical protein  56.77 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  55.66 
 
 		 336 aa  359  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3300  hypothetical protein  56.91 
 
 		 323 aa  350  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205377  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1292  hypothetical protein  55.12 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  52.1 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  52.1 
 
 		 345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  52.73 
 
 		 333 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  47.13 
 
 		 344 aa  326  4.0000000000000003e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  50.16 
 
 		 360 aa  324  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  49.68 
 
 		 339 aa  323  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  52.32 
 
 		 323 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2989  hypothetical protein  52.32 
 
 		 323 aa  320  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1975  hypothetical protein  52.82 
 
 		 328 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222715  normal  0.0272576 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  51.96 
 
 		 333 aa  316  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  48.37 
 
 		 327 aa  315  7e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1767  hypothetical protein  51.15 
 
 		 304 aa  314  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  48.04 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  48.73 
 
 		 325 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  48.62 
 
 		 339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  47.9 
 
 		 330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  50.65 
 
 		 328 aa  309  5e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  49.68 
 
 		 324 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  47.9 
 
 		 328 aa  306  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  47.9 
 
 		 328 aa  305  6e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  47.39 
 
 		 330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  47.39 
 
 		 330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2191  hypothetical protein  49.83 
 
 		 312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  50 
 
 		 328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  49.84 
 
 		 322 aa  302  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  49.4 
 
 		 335 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  47.71 
 
 		 328 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  46.45 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  46.08 
 
 		 331 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  47.54 
 
 		 304 aa  295  6e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.87 
 
 		 349 aa  293  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  47.06 
 
 		 325 aa  292  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  47.06 
 
 		 327 aa  291  7e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  50 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  44.55 
 
 		 336 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.81 
 
 		 327 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.9 
 
 		 328 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.98 
 
 		 330 aa  289  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  45.92 
 
 		 358 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.88 
 
 		 326 aa  289  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  45.93 
 
 		 324 aa  288  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  48.5 
 
 		 334 aa  288  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  41.95 
 
 		 329 aa  288  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  47.65 
 
 		 314 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  41.99 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  43.59 
 
 		 335 aa  285  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  44.48 
 
 		 330 aa  285  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  42.77 
 
 		 331 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  46.48 
 
 		 328 aa  285  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  42.77 
 
 		 331 aa  285  8e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  45.48 
 
 		 330 aa  285  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  47.39 
 
 		 339 aa  284  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  43.6 
 
 		 323 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.27 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.94 
 
 		 334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  41.46 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  44.63 
 
 		 321 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  43.83 
 
 		 337 aa  282  6.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.99 
 
 		 331 aa  282  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  44.55 
 
 		 336 aa  282  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.86 
 
 		 325 aa  281  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0231  hypothetical protein  43.44 
 
 		 329 aa  279  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  45.75 
 
 		 324 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  46.89 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  44.1 
 
 		 337 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  46.2 
 
 		 325 aa  277  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  44.13 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  43.38 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  45.42 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  41.62 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  44.3 
 
 		 328 aa  275  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  43.34 
 
 		 320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4192  hypothetical protein  44.41 
 
 		 331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  41.95 
 
 		 331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  44.12 
 
 		 334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  43.41 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  47.06 
 
 		 321 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  42.07 
 
 		 335 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  44.92 
 
 		 339 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  42.37 
 
 		 322 aa  271  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  45.69 
 
 		 335 aa  271  9e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  43.22 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0519  hypothetical protein  44.11 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515073  normal  0.0234005 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  43.45 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 		 326 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  40.99 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  46.89 
 
 		 327 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  42.57 
 
 		 335 aa  269  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0535  hypothetical protein  45.87 
 
 		 309 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  42.49 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  43.14 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  43.94 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  44.67 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  43.46 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>