281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0068 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  45.38 
 
 		 890 aa  643    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  100 
 
 		 895 aa  1790    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  44.61 
 
 		 901 aa  641    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  54.45 
 
 		 887 aa  902    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  46.34 
 
 		 911 aa  654    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  69.55 
 
 		 882 aa  1171    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  55.66 
 
 		 870 aa  906    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  55.92 
 
 		 878 aa  928    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  44.94 
 
 		 868 aa  620  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  44.79 
 
 		 898 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  41.24 
 
 		 870 aa  609  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  44.79 
 
 		 898 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  44.79 
 
 		 898 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  44.79 
 
 		 898 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  44.79 
 
 		 898 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  44.79 
 
 		 898 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  44.79 
 
 		 898 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  44.43 
 
 		 868 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  44.25 
 
 		 882 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  43.9 
 
 		 868 aa  595  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  43.84 
 
 		 868 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  43.84 
 
 		 868 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  43.84 
 
 		 868 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  44.15 
 
 		 868 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  41.81 
 
 		 871 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  42.49 
 
 		 935 aa  574  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  42.43 
 
 		 832 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  39.32 
 
 		 828 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  40.75 
 
 		 828 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  39.93 
 
 		 831 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  40.21 
 
 		 831 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  41.84 
 
 		 832 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  37.98 
 
 		 839 aa  502  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  38.82 
 
 		 831 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  36.11 
 
 		 834 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  39.73 
 
 		 868 aa  466  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  34.84 
 
 		 850 aa  450  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  37.25 
 
 		 834 aa  434  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  35.62 
 
 		 907 aa  431  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  37.15 
 
 		 855 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  35.56 
 
 		 855 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  35.81 
 
 		 833 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  37.88 
 
 		 844 aa  419  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  33.57 
 
 		 853 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  37.95 
 
 		 833 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  33.53 
 
 		 859 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  35.26 
 
 		 833 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  34.76 
 
 		 843 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  36.48 
 
 		 867 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  37.11 
 
 		 839 aa  405  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  35.76 
 
 		 846 aa  406  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  36.02 
 
 		 846 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  33.85 
 
 		 805 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  33.55 
 
 		 802 aa  399  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  33.46 
 
 		 805 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  36.4 
 
 		 851 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  31.49 
 
 		 850 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  37.25 
 
 		 845 aa  392  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  34.19 
 
 		 794 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  34.73 
 
 		 794 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  34.86 
 
 		 794 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  35.44 
 
 		 897 aa  381  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  33.08 
 
 		 804 aa  383  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  34.03 
 
 		 845 aa  373  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  36.33 
 
 		 837 aa  372  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  33.42 
 
 		 804 aa  360  8e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  34.52 
 
 		 848 aa  342  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  31.35 
 
 		 842 aa  322  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  33.37 
 
 		 835 aa  318  3e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  31.63 
 
 		 884 aa  316  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  32.52 
 
 		 885 aa  312  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  32.52 
 
 		 885 aa  312  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  32.4 
 
 		 885 aa  310  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  31.97 
 
 		 877 aa  307  6e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  31.55 
 
 		 877 aa  305  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  33.59 
 
 		 871 aa  302  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  34.62 
 
 		 480 aa  275  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  35.57 
 
 		 489 aa  271  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  34.15 
 
 		 567 aa  271  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  34.15 
 
 		 567 aa  271  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  34.15 
 
 		 567 aa  271  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  35.39 
 
 		 480 aa  270  8.999999999999999e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  37.17 
 
 		 488 aa  270  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3462  hypothetical protein  32.8 
 
 		 488 aa  267  5e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0178191 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0647  protein of unknown function DUF404  34.97 
 
 		 482 aa  266  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3157  hypothetical protein  33.95 
 
 		 472 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  33.94 
 
 		 480 aa  266  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7510  protein of unknown function DUF404  34.3 
 
 		 479 aa  266  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260838  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  33.47 
 
 		 471 aa  265  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  33.4 
 
 		 472 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  34.52 
 
 		 479 aa  266  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  34.14 
 
 		 520 aa  265  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  34.35 
 
 		 518 aa  265  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17370  hypothetical protein  34.21 
 
 		 552 aa  265  4e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0800507  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2164  protein of unknown function DUF404  33.61 
 
 		 479 aa  264  4.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  33.81 
 
 		 472 aa  264  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  33.4 
 
 		 489 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2208  hypothetical protein  33.47 
 
 		 479 aa  264  6.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2484  protein of unknown function DUF404  33.47 
 
 		 479 aa  264  6.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  33.94 
 
 		 480 aa  263  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>