More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1892 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1892  two-component system response regulator transcription regulator protein  100 
 
 		 240 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00502317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0438  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.75 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0424  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.51 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  hitchhiker  0.0000956185 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0432  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000322009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4558  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4665  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145034  normal  0.467542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0543  response regulator transcription regulator protein  40.27 
 
 		 246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0872  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 265 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0390  two component transcriptional regulator, winged helix family  37 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  37.83 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  36.73 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0060  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  35.24 
 
 		 235 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.475352  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  34.67 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  34.93 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  31.56 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  34.21 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.16 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  34.5 
 
 		 227 aa  124  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  29.65 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  29.65 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  29.65 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  29.65 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  29.65 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  29.65 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  29.65 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  29.65 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  29.96 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0059  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  32.29 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  29.96 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  29.96 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  29.96 
 
 		 296 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  29.96 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  29.54 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  29.54 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  32.3 
 
 		 236 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  32.51 
 
 		 237 aa  115  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3159  two component transcriptional regulator  30.67 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6592  two component transcriptional regulator  27.63 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.2732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  31.75 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  32.02 
 
 		 228 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  31.42 
 
 		 259 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0438  two component transcriptional regulator  31.58 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.316903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4652  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490614 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2192  DNA-binding response regulator  31.42 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2053  DNA-binding response regulator  30.97 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  33.82 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3520  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.58 
 
 		 236 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0476809  normal  0.130253 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1442  two component transcriptional regulator  27.11 
 
 		 227 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0208535  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  32.88 
 
 		 238 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4725  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  26.54 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144117  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0027  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2719  two component transcriptional regulator  30.7 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0943  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.97 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4056  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  32.71 
 
 		 275 aa  98.2  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6791  two component transcriptional regulator  30.53 
 
 		 198 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0454459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1076  two-component system response regulator transcription regulator protein  29.79 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  30.48 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  29.56 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  28.95 
 
 		 231 aa  98.2  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  28.16 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  32.68 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.72 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3599  two component transcriptional regulator  30.53 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1268  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.45 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  29.06 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  24.88 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1977  DNA-binding response regulator  27.27 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.166768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  29.06 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.95 
 
 		 226 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  30.43 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.58 
 
 		 225 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  31.28 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  33.01 
 
 		 229 aa  93.6  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0416  two component transcriptional regulator  30.4 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  31.1 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  30.62 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1588  DNA-binding response regulator  30.09 
 
 		 230 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  31.13 
 
 		 229 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  28.57 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.19 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  28.57 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1060  two component transcriptional regulator  26.99 
 
 		 230 aa  92.4  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0484  two component transcriptional regulator  30.57 
 
 		 254 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.81925 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  30.14 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.21 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.14 
 
 		 234 aa  91.7  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2059  DNA-binding response regulator  27.75 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000985599  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0442  two component transcriptional regulator  29.96 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.248748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3292  two component transcriptional regulator  30.84 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1789  alkaline phosphatase synthesis response regulator  27.27 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.19 
 
 		 230 aa  91.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>