More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1353 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1353  thiamine pyrophosphate protein  100 
 
 		 581 aa  1175    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  60.57 
 
 		 564 aa  676    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  58.78 
 
 		 561 aa  659    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1291  thiamine pyrophosphate protein  86.99 
 
 		 575 aa  1013    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0542091  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2817  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  58.05 
 
 		 570 aa  653    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  87.16 
 
 		 575 aa  1037    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2213  Fis family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 580 aa  647    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.851331  normal  0.770524 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1865  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  58.27 
 
 		 572 aa  629  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3016  thiamine pyrophosphate protein  57.76 
 
 		 566 aa  623  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0051  thiamine pyrophosphate protein  57.09 
 
 		 574 aa  621  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0138  thiamine pyrophosphate protein  58.84 
 
 		 567 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2917  thiamine pyrophosphate protein  59.03 
 
 		 567 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0138  thiamine pyrophosphate protein  59.03 
 
 		 567 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0152  thiamine pyrophosphate protein  58.84 
 
 		 567 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0128  thiamine pyrophosphate protein  58.84 
 
 		 567 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0427824  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0136  thiamine pyrophosphate protein  58.84 
 
 		 567 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3885  thiamine pyrophosphate protein  57.84 
 
 		 572 aa  608  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1548  thiamine pyrophosphate protein  58.7 
 
 		 567 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2989  thiamine pyrophosphate protein  58.7 
 
 		 567 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0133  thiamine pyrophosphate protein  58.7 
 
 		 567 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.377635  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3318  thiamine pyrophosphate protein  58.48 
 
 		 567 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3250  thiamine pyrophosphate protein  57.79 
 
 		 567 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492745  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4004  thiamine pyrophosphate protein  58.7 
 
 		 567 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3054  thiamine pyrophosphate protein  58.7 
 
 		 567 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3316  thiamine pyrophosphate protein  58.7 
 
 		 567 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3933  thiamine pyrophosphate protein  58.7 
 
 		 567 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  56.73 
 
 		 568 aa  600  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  54.66 
 
 		 570 aa  595  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  56.44 
 
 		 548 aa  597  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  54.45 
 
 		 549 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  56.23 
 
 		 572 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  53.25 
 
 		 550 aa  578  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  55.44 
 
 		 564 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  55.64 
 
 		 552 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2520  thiamine pyrophosphate protein  53.69 
 
 		 565 aa  566  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121235 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  54.5 
 
 		 572 aa  567  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1340  thiamine pyrophosphate protein  53.69 
 
 		 565 aa  565  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  53.27 
 
 		 555 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0313  thiamine pyrophosphate protein  52.96 
 
 		 557 aa  561  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  52.62 
 
 		 552 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1643  thiamine pyrophosphate protein  55.64 
 
 		 559 aa  561  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  52.5 
 
 		 556 aa  557  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  54.35 
 
 		 582 aa  552  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  54.51 
 
 		 552 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1636  thiamine pyrophosphate protein  53.43 
 
 		 559 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0882  thiamine pyrophosphate protein  50.63 
 
 		 558 aa  546  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0789  thiamine pyrophosphate protein  52.97 
 
 		 564 aa  544  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000306468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  51.15 
 
 		 567 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  53.91 
 
 		 556 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0284  thiamine pyrophosphate protein  51.62 
 
 		 576 aa  534  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0633  thiamine pyrophosphate protein  54.11 
 
 		 553 aa  531  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151923  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1264  thiamine pyrophosphate protein  54.03 
 
 		 558 aa  527  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  50.63 
 
 		 559 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3275  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  50.81 
 
 		 559 aa  525  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4600  thiamine pyrophosphate protein  53.87 
 
 		 567 aa  519  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5061  thiamine pyrophosphate protein  53.69 
 
 		 567 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  0.490143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6522  thiamine pyrophosphate protein  52.78 
 
 		 561 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  51.16 
 
 		 558 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1101  thiamine pyrophosphate protein  49.73 
 
 		 559 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.805378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6728  thiamine pyrophosphate protein  51.35 
 
 		 566 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988038  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1163  thiamine pyrophosphate protein  48.5 
 
 		 568 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  47.42 
 
 		 567 aa  496  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  47.64 
 
 		 538 aa  472  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  42 
 
 		 552 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  42.83 
 
 		 551 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  42.09 
 
 		 543 aa  365  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  38.93 
 
 		 551 aa  348  1e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  39.54 
 
 		 583 aa  344  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  38.59 
 
 		 561 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2955  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.47 
 
 		 565 aa  325  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0915  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  40.56 
 
 		 560 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0036  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.84 
 
 		 543 aa  310  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1114  putative pyruvate decarboxylase  37.57 
 
 		 587 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1115  putative acetolactate synthase large subunit  36.91 
 
 		 586 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0471394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  32.69 
 
 		 566 aa  263  8e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.37 
 
 		 586 aa  262  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.54 
 
 		 574 aa  261  3e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.71 
 
 		 552 aa  257  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.27 
 
 		 612 aa  256  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29 
 
 		 567 aa  253  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.64 
 
 		 588 aa  252  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.62 
 
 		 572 aa  248  2e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1921  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.12 
 
 		 576 aa  248  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.299558 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.7 
 
 		 548 aa  246  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.28 
 
 		 548 aa  244  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.76 
 
 		 548 aa  244  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.13 
 
 		 548 aa  244  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.57 
 
 		 593 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.78 
 
 		 564 aa  243  5e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  29.96 
 
 		 572 aa  243  7e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1642  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.9 
 
 		 618 aa  243  7.999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132379  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.53 
 
 		 619 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.6 
 
 		 562 aa  242  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  32.1 
 
 		 587 aa  242  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.78 
 
 		 561 aa  241  4e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.87 
 
 		 548 aa  241  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.07 
 
 		 548 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.14 
 
 		 563 aa  239  8e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.46 
 
 		 552 aa  239  9e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  30.05 
 
 		 569 aa  239  9e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>