More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2341 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2341  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  786    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1048  hypothetical protein  87.76 
 
 		 392 aa  695    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1016  hypothetical protein  98.72 
 
 		 392 aa  774    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2134  hypothetical protein  72.47 
 
 		 391 aa  566  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1884  hypothetical protein  68.56 
 
 		 395 aa  530  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228041  normal  0.262576 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1145  hypothetical protein  64.83 
 
 		 391 aa  508  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0013509  normal  0.0789492 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1794  hypothetical protein  68.48 
 
 		 393 aa  478  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000759831  normal  0.944472 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0772  hypothetical protein  40.2 
 
 		 389 aa  255  9e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0068  hypothetical protein  38.68 
 
 		 389 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19832e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0085  hypothetical protein  38.23 
 
 		 389 aa  250  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4642  hypothetical protein  41.53 
 
 		 387 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0084  hypothetical protein  39.22 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.928121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3457  hypothetical protein  41.96 
 
 		 390 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171276  hitchhiker  0.0000085327 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2474  hypothetical protein  41.27 
 
 		 393 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.651343  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6440  hypothetical protein  42.18 
 
 		 387 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0145661 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3621  hypothetical protein  37.08 
 
 		 389 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3433  hypothetical protein  39.85 
 
 		 391 aa  239  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2412  hypothetical protein  40.46 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0455  hypothetical protein  37.6 
 
 		 387 aa  230  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01830  arylformamidase, putative  36.41 
 
 		 451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  36.01 
 
 		 400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10411  aspartate aminotransferase  32.24 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  33.7 
 
 		 399 aa  152  7e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1225  aspartate aminotransferase  30.45 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1196  aspartate aminotransferase  30.45 
 
 		 388 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0436  aspartate aminotransferase  29.81 
 
 		 381 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3695  aspartate aminotransferase  31.14 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  33.15 
 
 		 392 aa  142  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  33.52 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1578  aspartate aminotransferase  28.37 
 
 		 387 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.776902  hitchhiker  0.00064422 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10418  predicted protein  30.61 
 
 		 375 aa  135  8e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00425999  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  34.49 
 
 		 401 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  31.89 
 
 		 383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  28.31 
 
 		 398 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  28.1 
 
 		 396 aa  130  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1664  aminotransferase, class I and II  31.28 
 
 		 403 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  29.54 
 
 		 394 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  30.03 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  31.07 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1791  aminotransferase class I and II  33.9 
 
 		 404 aa  122  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.117721 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  31.28 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  33.83 
 
 		 397 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  29.14 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  28.27 
 
 		 409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  28 
 
 		 396 aa  119  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  27.65 
 
 		 370 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  29.48 
 
 		 382 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  31.89 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  27.72 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0877  aminotransferase  28.97 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.706864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  29.36 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  27.49 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  33.97 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  27.63 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  26.9 
 
 		 387 aa  116  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  30.54 
 
 		 403 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  29.2 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  30.2 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  28.24 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  30.54 
 
 		 414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  34.68 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2213  aminotransferase, class I and II  27.02 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  26.65 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  32.6 
 
 		 387 aa  113  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  27.49 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  30.12 
 
 		 393 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  31.13 
 
 		 382 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  30.72 
 
 		 383 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07891  aspartate aminotransferase  24.28 
 
 		 409 aa  112  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  32.7 
 
 		 400 aa  112  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  34.19 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  31.3 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  25.23 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  30.63 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0852  aminotransferase class I and II  27.25 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  30.79 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3299  putative aminotransferase  29.83 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  30.7 
 
 		 391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  31.33 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  32.32 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  30.25 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  30.63 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  29.86 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0177  alanine aminotransferase  26.9 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.127101 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  23.64 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  26.29 
 
 		 370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  27.95 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  26.3 
 
 		 375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  27.7 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  30.72 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  29.52 
 
 		 402 aa  110  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  31.12 
 
 		 398 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0119  putative aminotransferase  29.83 
 
 		 384 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.234511  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1973  aminotransferase, class I and II  27.23 
 
 		 429 aa  110  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238227  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0031  putative aminotransferase  28.42 
 
 		 384 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  29.18 
 
 		 411 aa  109  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0119  putative aminotransferase  29.75 
 
 		 384 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  31.06 
 
 		 394 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3334  putative aminotransferase  30.7 
 
 		 385 aa  109  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.946068  hitchhiker  0.000376908 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  29.97 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>