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for query gene RPC_3596 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 516 aa  1010    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  56.87 
 
 		 528 aa  554  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.27 
 
 		 523 aa  543  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.46 
 
 		 532 aa  536  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  50.38 
 
 		 524 aa  508  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2727  multidrug resistance transmembrane protein  53.25 
 
 		 511 aa  491  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.03 
 
 		 535 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.72 
 
 		 528 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.91 
 
 		 528 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3275  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.91 
 
 		 528 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3900  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.53 
 
 		 528 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.39 
 
 		 529 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4466  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.53 
 
 		 528 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.87368  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3627  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.53 
 
 		 528 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126338  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.88 
 
 		 519 aa  420  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.9 
 
 		 535 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  41.47 
 
 		 519 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.83 
 
 		 523 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.2 
 
 		 516 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.4 
 
 		 516 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  41.34 
 
 		 499 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40 
 
 		 516 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.17 
 
 		 517 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  38.57 
 
 		 534 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.34 
 
 		 526 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.57 
 
 		 516 aa  361  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.64 
 
 		 535 aa  360  3e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.96 
 
 		 539 aa  360  3e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.42 
 
 		 535 aa  360  4e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.24 
 
 		 526 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.45 
 
 		 535 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.64 
 
 		 542 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.64 
 
 		 542 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.86 
 
 		 542 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.86 
 
 		 542 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  38.19 
 
 		 539 aa  352  8e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.08 
 
 		 538 aa  351  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.65 
 
 		 543 aa  346  6e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.61 
 
 		 540 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.08 
 
 		 536 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  40.85 
 
 		 529 aa  342  7e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.83 
 
 		 539 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.64 
 
 		 527 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.12 
 
 		 529 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.59 
 
 		 527 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.16 
 
 		 527 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.16 
 
 		 527 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1089  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.55 
 
 		 525 aa  311  1e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.831472  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0116  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.41 
 
 		 529 aa  303  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009504  BOV_A0107  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.41 
 
 		 529 aa  303  7.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.905883  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.53 
 
 		 525 aa  301  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 		 514 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.17 
 
 		 530 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.62 
 
 		 526 aa  296  7e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2345  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 		 524 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.67 
 
 		 524 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506571  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.06 
 
 		 528 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.18 
 
 		 530 aa  293  6e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.12 
 
 		 523 aa  293  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6187  putative multidrug resistance protein B  34.5 
 
 		 529 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315728  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5485  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.18 
 
 		 524 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4469  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.79 
 
 		 525 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3631  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.18 
 
 		 524 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.3 
 
 		 504 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4101  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.79 
 
 		 525 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.420872 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3754  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 		 524 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4609  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 		 524 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3769  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.61 
 
 		 524 aa  290  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.3 
 
 		 527 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4583  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36 
 
 		 525 aa  289  8e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3836  MFS permease  32.43 
 
 		 525 aa  289  9e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.02 
 
 		 531 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.83 
 
 		 536 aa  286  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.75 
 
 		 521 aa  286  7e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.94 
 
 		 520 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.74 
 
 		 537 aa  282  9e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.13 
 
 		 528 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0282921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.23 
 
 		 532 aa  281  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  36.06 
 
 		 508 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.38 
 
 		 523 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.5 
 
 		 515 aa  279  7e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.2 
 
 		 528 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4976  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 524 aa  279  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.88 
 
 		 517 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.27 
 
 		 511 aa  277  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.2 
 
 		 532 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.96 
 
 		 532 aa  274  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.72 
 
 		 543 aa  273  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.62 
 
 		 522 aa  272  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.057108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.23 
 
 		 532 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.65 
 
 		 516 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.192048  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.94 
 
 		 519 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_010511  M446_6560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.81 
 
 		 529 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0671945  normal  0.0275622 
 
 
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NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.16 
 
 		 530 aa  269  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
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NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.88 
 
 		 515 aa  269  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_48300  putative MFS transporter  35.2 
 
 		 503 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  normal  0.132172 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.62 
 
 		 532 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
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NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.08 
 
 		 515 aa  263  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.51 
 
 		 526 aa  263  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.65 
 
 		 530 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
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