More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0073 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 329 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  75.26 
 
 		 314 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  71.52 
 
 		 329 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  70.85 
 
 		 372 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  71.13 
 
 		 314 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  64.83 
 
 		 332 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  65.51 
 
 		 325 aa  391  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  65.02 
 
 		 320 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  69.15 
 
 		 318 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  63.86 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  63.94 
 
 		 337 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  67.47 
 
 		 313 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  58.45 
 
 		 300 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  59.81 
 
 		 322 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  59.81 
 
 		 322 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  58.36 
 
 		 333 aa  334  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  64.73 
 
 		 318 aa  334  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  58.36 
 
 		 333 aa  334  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  66.21 
 
 		 333 aa  332  8e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  59.3 
 
 		 324 aa  328  6e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  58.56 
 
 		 329 aa  322  7e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  56.89 
 
 		 309 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  54.76 
 
 		 297 aa  312  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  59.79 
 
 		 319 aa  310  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  62.32 
 
 		 336 aa  309  5e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  53.68 
 
 		 373 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  56.23 
 
 		 306 aa  298  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  58.59 
 
 		 346 aa  295  5e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  56.25 
 
 		 366 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  57.73 
 
 		 320 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  49.55 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  56.84 
 
 		 328 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  55.41 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  54.76 
 
 		 302 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  50.5 
 
 		 306 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  50.3 
 
 		 335 aa  248  8e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  49.14 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  46.89 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  44.12 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  44.48 
 
 		 307 aa  235  8e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  42.76 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  43.11 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  40.36 
 
 		 314 aa  219  6e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  39.13 
 
 		 296 aa  195  8.000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  38.41 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  38.26 
 
 		 326 aa  192  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  38.06 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  39.1 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  37.96 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  38.41 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  36.59 
 
 		 342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  41.16 
 
 		 365 aa  182  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  40.15 
 
 		 304 aa  182  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  36.15 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  35.89 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  35.25 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.26 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  37.64 
 
 		 299 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.64 
 
 		 299 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  37.64 
 
 		 299 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  37.64 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  38.17 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  39.13 
 
 		 307 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  39.42 
 
 		 342 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  34.45 
 
 		 301 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  34.45 
 
 		 301 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  34.45 
 
 		 301 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  34.45 
 
 		 301 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  35.82 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  37.64 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  34.39 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 		 314 aa  172  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3688  cation diffusion facilitator family transporter  35.27 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0974105  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  36.2 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  41.11 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3783  cation diffusion facilitator family transporter  35.27 
 
 		 341 aa  169  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  34.93 
 
 		 326 aa  169  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  34.67 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  34.81 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.93 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  35.47 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  35.86 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  34.93 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  33.11 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  36.77 
 
 		 312 aa  166  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  37.02 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  31.94 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  37.59 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  34.78 
 
 		 309 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  33.68 
 
 		 347 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  37.98 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  34.38 
 
 		 321 aa  162  7e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  34.38 
 
 		 321 aa  162  7e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1735  cation diffusion facilitator family transporter  37.94 
 
 		 342 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 		 342 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  36.98 
 
 		 342 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  29.45 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  33.33 
 
 		 378 aa  160  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  30.39 
 
 		 398 aa  159  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>