More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3375 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3604  heavy metal sensor histidine kinase  92.86 
 
 
462 aa  831  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.514788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3375  heavy metal sensor kinase  100 
 
 
462 aa  929  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  58.03 
 
 
463 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  58.26 
 
 
463 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  55.15 
 
 
474 aa  478  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  53.35 
 
 
481 aa  461  1e-128  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  46.41 
 
 
466 aa  405  1e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  46.51 
 
 
466 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3380  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  47.05 
 
 
471 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1380  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  42.05 
 
 
461 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 
480 aa  313  5e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 
465 aa  307  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0203  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 
462 aa  306  5e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
480 aa  306  5e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 
469 aa  305  8e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
472 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  37.69 
 
 
467 aa  289  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
469 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
469 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
469 aa  282  8e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
464 aa  279  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  38.49 
 
 
465 aa  276  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
471 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 
471 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  34.29 
 
 
476 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
476 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 
493 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
487 aa  254  2e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 
486 aa  254  2e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
493 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1159  heavy metal sensor kinase subfamily  36.67 
 
 
454 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.433807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1054  heavy metal sensor kinase subfamily  36.67 
 
 
454 aa  249  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1170  heavy metal sensor kinase family protein  36.45 
 
 
454 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1190  heavy metal sensor kinase subfamily  36.67 
 
 
454 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1205  heavy metal sensor kinase subfamily  36.22 
 
 
454 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  35.82 
 
 
486 aa  246  7e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 
463 aa  244  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
462 aa  239  7e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 
461 aa  239  9e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 
486 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1504  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 
486 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0798501  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
471 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.44 
 
 
468 aa  235  1e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6988  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
486 aa  234  2e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  0.65716 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  43.14 
 
 
462 aa  235  2e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 
462 aa  233  4e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 
458 aa  233  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  40.69 
 
 
463 aa  233  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.72 
 
 
467 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
458 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
489 aa  229  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
468 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
468 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
468 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 
467 aa  227  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  38.62 
 
 
480 aa  227  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 
473 aa  226  5e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
467 aa  226  5e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 
460 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  33.47 
 
 
483 aa  226  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
468 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 
447 aa  226  9e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  34.37 
 
 
464 aa  226  9e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 
461 aa  225  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  34.16 
 
 
464 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  42.55 
 
 
460 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
474 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
480 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
468 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  34.16 
 
 
464 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  38.28 
 
 
482 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  38.28 
 
 
482 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  34.16 
 
 
464 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  34.16 
 
 
464 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  34.16 
 
 
464 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  38.28 
 
 
482 aa  224  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
474 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
474 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 
477 aa  223  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  38.15 
 
 
482 aa  223  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  37.75 
 
 
470 aa  223  8e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  37.09 
 
 
491 aa  222  9e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  37.09 
 
 
491 aa  222  1e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.2 
 
 
460 aa  221  2e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0947817 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  37.98 
 
 
482 aa  221  2e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  37.09 
 
 
491 aa  221  2e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  37.98 
 
 
475 aa  221  2e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43 
 
 
489 aa  221  2e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
474 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  34.03 
 
 
715 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
445 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 
469 aa  220  4e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  35.15 
 
 
431 aa  220  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.92 
 
 
481 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
477 aa  219  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  42.11 
 
 
464 aa  219  8e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  39.32 
 
 
459 aa  219  9e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  32.9 
 
 
484 aa  219  9e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.9 
 
 
446 aa  219  9e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  32.18 
 
 
484 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>