110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4597 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  78.81 
 
 		 151 aa  249  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  76.16 
 
 		 151 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  75.5 
 
 		 151 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  58.94 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  63.45 
 
 		 150 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  57.53 
 
 		 151 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  57.24 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  54.3 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  54 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  55.81 
 
 		 184 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  45.45 
 
 		 152 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  44.22 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  51.37 
 
 		 150 aa  146  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  51.39 
 
 		 149 aa  140  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  41.61 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  40.69 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  38.19 
 
 		 149 aa  117  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  41.38 
 
 		 150 aa  116  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  45.99 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  41.26 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  41.55 
 
 		 150 aa  110  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16060  hypothetical protein  41.86 
 
 		 86 aa  73.9  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02923  hypothetical protein  35.11 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  28.89 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  26.21 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02732  hypothetical protein  38.67 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  29.17 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  26.67 
 
 		 224 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  25.52 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  29.2 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  31.72 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  25.58 
 
 		 322 aa  50.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  21.77 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  24.22 
 
 		 223 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  25.55 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  30.83 
 
 		 216 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  27.97 
 
 		 230 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  27.59 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  27.97 
 
 		 230 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  27.97 
 
 		 230 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  24.22 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  24.82 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  31.4 
 
 		 231 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05745  hypothetical protein  52.63 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.948839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  24.82 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  26.43 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  24.82 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  25.37 
 
 		 191 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  25.37 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  25.71 
 
 		 253 aa  47.4  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  29.06 
 
 		 230 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  27.89 
 
 		 176 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  27.36 
 
 		 197 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  31.4 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  28.89 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  25 
 
 		 338 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  22.02 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  22.58 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  27.88 
 
 		 1345 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  31.17 
 
 		 1372 aa  45.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  27.13 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  28.45 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  29.31 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  30.43 
 
 		 258 aa  45.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  28.41 
 
 		 214 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  22.98 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  23.85 
 
 		 314 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  27.82 
 
 		 340 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4549  hypothetical protein  22.01 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  26.32 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  30 
 
 		 282 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  26.45 
 
 		 253 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  25.9 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  25.87 
 
 		 179 aa  43.5  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5035  protein of unknown function DUF1568  23.42 
 
 		 214 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.916294 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  30 
 
 		 305 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  23.36 
 
 		 335 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  27.34 
 
 		 287 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  26.51 
 
 		 312 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  24.62 
 
 		 312 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  25.78 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  21.88 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  24.09 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  23.85 
 
 		 316 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  25.71 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  23.86 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  21.99 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  23.31 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  25.84 
 
 		 323 aa  41.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  24.42 
 
 		 241 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  26.37 
 
 		 221 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  21.99 
 
 		 163 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  25.84 
 
 		 288 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  25.84 
 
 		 288 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  26.81 
 
 		 179 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  25.81 
 
 		 232 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  23.73 
 
 		 236 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  27.97 
 
 		 239 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>