20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_05745 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_05745  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  138  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.948839  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  55.26 
 
 
151 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  55.26 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  52.63 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  52.63 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  50 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  52.94 
 
 
152 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  57.89 
 
 
149 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  50 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  52.63 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  52.63 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  50 
 
 
152 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  52.63 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  30.77 
 
 
149 aa  44.3  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02923  hypothetical protein  55.56 
 
 
169 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  50 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  50 
 
 
184 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  52.94 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  60 
 
 
151 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  58.62 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>