85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3246 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  100 
 
 		 528 aa  1061    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  57.79 
 
 		 533 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  57.79 
 
 		 533 aa  595  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  57.79 
 
 		 533 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  55.45 
 
 		 534 aa  568  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  52.08 
 
 		 530 aa  524  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  41.71 
 
 		 524 aa  415  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  41.73 
 
 		 527 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  40.9 
 
 		 523 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2910  ImpA domain-containing protein  48.6 
 
 		 791 aa  266  8e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.401848 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  28.6 
 
 		 508 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0162  ImpA domain-containing protein  28.46 
 
 		 498 aa  124  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  27.97 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  27.5 
 
 		 518 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  27.27 
 
 		 518 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  24.38 
 
 		 789 aa  94.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  23.19 
 
 		 533 aa  87  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  27.35 
 
 		 518 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  26.17 
 
 		 520 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1125  putative type VI secretion protein VasJ  20.08 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  22.4 
 
 		 522 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1219  ImpA domain-containing protein  27.93 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.192362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1100  type VI secretion-associated protein, family  28.69 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  30.81 
 
 		 790 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3243  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  22.27 
 
 		 474 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2517  type VI secretion-associated protein  24.69 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1082  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  22.06 
 
 		 475 aa  63.5  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.424761  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3721  ImpA domain-containing protein  24.59 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1208  ImpA domain-containing protein  22.63 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  31.36 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  31.36 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0227  ImpA domain-containing protein  25.93 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0229  ImpA domain-containing protein  25.5 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.865531  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  31.82 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4072  hypothetical protein  22.84 
 
 		 488 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00713132  unclonable  0.00000101691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0398  type VI secretion-associated protein  23.93 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0325  ImpA domain-containing protein  23.93 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  29.09 
 
 		 437 aa  57  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0235  ImpA domain protein  25.1 
 
 		 470 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0873  ImpA-like N-terminal family protein  32.54 
 
 		 598 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2626  hypothetical protein  22.98 
 
 		 487 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0739443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2129  ImpA domain-containing protein  22.98 
 
 		 487 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0056  ImpA domain-containing protein  28.77 
 
 		 480 aa  54.3  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1217  ImpA domain-containing protein  31.62 
 
 		 454 aa  53.5  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249719  normal  0.176595 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1098  ImpA domain protein  31.62 
 
 		 453 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2583  ImpA domain-containing protein  31.75 
 
 		 455 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2485  ImpA domain-containing protein  34.23 
 
 		 455 aa  53.5  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  38.18 
 
 		 366 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2120  ImpA-related N-terminal family protein  30.16 
 
 		 635 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2022  ImpA-related N-terminal family protein  30.16 
 
 		 623 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0601  hypothetical protein  30.16 
 
 		 630 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0530  ImpA-like N-terminal family protein  30.16 
 
 		 627 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.961016  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0712  hypothetical protein  30.16 
 
 		 638 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0747  hypothetical protein  30.16 
 
 		 642 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.449212  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1668  ImpA-related N-terminal family protein  30.16 
 
 		 653 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.894506  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  32.26 
 
 		 373 aa  51.6  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2997  ImpA domain-containing protein  36.63 
 
 		 455 aa  51.2  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  37.27 
 
 		 366 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0018  hypothetical protein  22.95 
 
 		 469 aa  50.8  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  33.02 
 
 		 367 aa  50.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  27.74 
 
 		 357 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0225  ImpA domain-containing protein  32.04 
 
 		 450 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347157  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0233  ImpA domain protein  32.04 
 
 		 469 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.845449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2795  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  27.05 
 
 		 479 aa  49.7  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  33.01 
 
 		 383 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0227  ImpA domain-containing protein  32.04 
 
 		 450 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527104  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  33.33 
 
 		 342 aa  48.9  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3135  ImpA-related N-terminal domain-containing protein  29.14 
 
 		 458 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  35.64 
 
 		 345 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1084  ImpA domain protein  37.04 
 
 		 478 aa  47.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3241  ImpA domain protein  37.04 
 
 		 478 aa  47.4  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  31.07 
 
 		 354 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  30.53 
 
 		 363 aa  46.6  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  31.43 
 
 		 369 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  30.48 
 
 		 373 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  30.48 
 
 		 373 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  32 
 
 		 337 aa  44.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.7 
 
 		 360 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1804  ImpA domain-containing protein  30.17 
 
 		 463 aa  44.3  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579437  normal  0.0143873 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  28.68 
 
 		 373 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  28.23 
 
 		 373 aa  43.9  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  28.68 
 
 		 373 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  28.68 
 
 		 373 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  29.03 
 
 		 373 aa  43.5  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  27.41 
 
 		 362 aa  43.5  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>