More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1361 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  100 
 
 		 405 aa  831    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  79.4 
 
 		 407 aa  674    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  75.68 
 
 		 404 aa  624  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  68.23 
 
 		 409 aa  586  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  68.66 
 
 		 407 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  59.8 
 
 		 410 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  58.91 
 
 		 408 aa  476  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  46.85 
 
 		 400 aa  347  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  43.8 
 
 		 401 aa  345  1e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  43.73 
 
 		 395 aa  342  5.999999999999999e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  42.49 
 
 		 391 aa  341  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  43.91 
 
 		 400 aa  333  3e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  42.42 
 
 		 397 aa  330  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  42.49 
 
 		 395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  39.34 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  39.68 
 
 		 390 aa  296  6e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  39.54 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  42.09 
 
 		 389 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  40.16 
 
 		 389 aa  285  8e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  41.84 
 
 		 401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  39.53 
 
 		 402 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  42.67 
 
 		 407 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  41.6 
 
 		 394 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  41.13 
 
 		 390 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  40.05 
 
 		 394 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  42.93 
 
 		 391 aa  279  6e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  39.55 
 
 		 394 aa  279  7e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  39.58 
 
 		 380 aa  278  9e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  40.57 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  40.99 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  40.43 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  38.82 
 
 		 425 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  41.1 
 
 		 392 aa  277  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  37 
 
 		 415 aa  276  4e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  38.56 
 
 		 397 aa  275  7e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  39.07 
 
 		 403 aa  275  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  39.84 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  42.93 
 
 		 390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  41.28 
 
 		 387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  39.59 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  41.12 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  38.96 
 
 		 437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  38.92 
 
 		 397 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  41.24 
 
 		 387 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  39.1 
 
 		 404 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  41.24 
 
 		 387 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  38.82 
 
 		 398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  39.71 
 
 		 431 aa  272  7e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.01 
 
 		 381 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  38.68 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  36.83 
 
 		 391 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  39.29 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  39.36 
 
 		 427 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  40.38 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  40.37 
 
 		 388 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  40.97 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  39.07 
 
 		 387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  39.28 
 
 		 407 aa  270  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.71 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  40 
 
 		 406 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  38.78 
 
 		 430 aa  269  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  39.37 
 
 		 381 aa  269  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  41.27 
 
 		 390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1094  amidohydrolase  39.03 
 
 		 394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  36.8 
 
 		 399 aa  269  7e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  40.41 
 
 		 439 aa  269  7e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  40.41 
 
 		 402 aa  269  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  38.22 
 
 		 401 aa  269  7e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  38.06 
 
 		 403 aa  269  8e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  39.49 
 
 		 396 aa  269  8e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  40.81 
 
 		 387 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  40.74 
 
 		 395 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  40.54 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  39.23 
 
 		 396 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  37.96 
 
 		 401 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  40.27 
 
 		 387 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  40.1 
 
 		 393 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  40.26 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1263  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  38.54 
 
 		 389 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.804068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  38.06 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  40.53 
 
 		 387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  38.48 
 
 		 381 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  39.01 
 
 		 388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  39.73 
 
 		 399 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  38.25 
 
 		 432 aa  266  5e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  39.84 
 
 		 405 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  40.27 
 
 		 387 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  37.15 
 
 		 396 aa  266  5.999999999999999e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  36.39 
 
 		 398 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  37.73 
 
 		 401 aa  265  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  39.64 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  39.48 
 
 		 386 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  36.76 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  38.3 
 
 		 415 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  37.98 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1289  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.54 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1463  aminoacylase  38.54 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1392  n-acyl-l-amino acid amidohydrolase  38.54 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  38.58 
 
 		 390 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3918  aminoacylase  38.06 
 
 		 389 aa  263  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>