123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3144 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  100 
 
 		 830 aa  1670    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  33.67 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  32.23 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  33.06 
 
 		 398 aa  120  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3196  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  39.26 
 
 		 408 aa  117  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109527 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 394 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  35.37 
 
 		 775 aa  116  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 394 aa  112  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2943  ABC-2 type transporter  27.33 
 
 		 405 aa  107  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1676  ABC-2 type transporter  31.79 
 
 		 413 aa  105  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  29.31 
 
 		 403 aa  102  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  27.25 
 
 		 395 aa  98.6  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1957  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 388 aa  97.8  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0574803  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19710  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 		 193 aa  89.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0131  CAAX amino terminal protease family protein  28.8 
 
 		 308 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000026669  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0129  CAAX amino terminal protease family protein  28.8 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  34.86 
 
 		 280 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02800  ABC transporter sodium permease  27.31 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3872  ABC transporter sodium permease  24.14 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 		 405 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  23.39 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  34.29 
 
 		 338 aa  67.4  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  37.86 
 
 		 362 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3799  Na+ ABC transporter permease protein  29.71 
 
 		 397 aa  63.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.578241  normal  0.0174839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  37.17 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3782  ABC-2 type transporter  26.88 
 
 		 378 aa  60.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  28.09 
 
 		 292 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0581  abortive infection protein  31.73 
 
 		 302 aa  60.1  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000196506  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1500  ABC transporter sodium permease  24.01 
 
 		 394 aa  59.7  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  38.82 
 
 		 237 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  40 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  39.08 
 
 		 236 aa  58.9  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  39.08 
 
 		 236 aa  58.9  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1445  ABC transporter sodium permease  24.01 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  39.08 
 
 		 236 aa  58.9  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  39.08 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4192  ABC-2 type transporter  27.32 
 
 		 381 aa  57  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148286  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0066  transport protein, putative  25.86 
 
 		 378 aa  55.5  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  25.97 
 
 		 264 aa  55.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  28.48 
 
 		 267 aa  54.7  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4462  ABC-2 type transporter  24.17 
 
 		 382 aa  54.3  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.510043 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  28.47 
 
 		 261 aa  52  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3979  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 377 aa  52.4  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.508382  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0069  transport protein, putative  25.15 
 
 		 379 aa  51.6  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1450  abortive infection protein  26.96 
 
 		 336 aa  51.6  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101728  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4866  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 		 387 aa  51.6  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  32.82 
 
 		 237 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  29.9 
 
 		 321 aa  51.6  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  29.82 
 
 		 221 aa  51.2  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  40.21 
 
 		 246 aa  50.8  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0359  metal-dependent membrane protease  28.42 
 
 		 306 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  30.12 
 
 		 246 aa  50.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4280  transport protein, putative  25.36 
 
 		 379 aa  50.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0069  transport protein, putative  25.36 
 
 		 379 aa  50.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0074  transport protein, putative  25.36 
 
 		 379 aa  50.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  35.92 
 
 		 241 aa  50.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  34.12 
 
 		 237 aa  50.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3577  transport protein, putative  26.8 
 
 		 378 aa  50.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0071  transport protein, putative  24.88 
 
 		 379 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0252  abortive infection protein  32.99 
 
 		 399 aa  49.3  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621218  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  34.09 
 
 		 273 aa  49.3  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3735  heavy metal efflux pump CzcA  28.3 
 
 		 392 aa  48.9  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  31.91 
 
 		 528 aa  48.5  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4723  CAAX family protease  32.32 
 
 		 274 aa  48.5  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  22.39 
 
 		 312 aa  48.5  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5434  Abortive infection protein  36.36 
 
 		 250 aa  48.5  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.245551  normal  0.0723746 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  32.41 
 
 		 432 aa  48.1  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0055  transport protein, putative  24.1 
 
 		 379 aa  48.1  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  29.91 
 
 		 313 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  28.35 
 
 		 308 aa  47.8  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  29.91 
 
 		 313 aa  47.8  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4721  abortive infection protein  31.25 
 
 		 194 aa  47.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  31.46 
 
 		 448 aa  47.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  30.53 
 
 		 262 aa  47  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1471  hypothetical protein  33.72 
 
 		 311 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1132  Abortive infection protein  32.26 
 
 		 324 aa  47.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349362  hitchhiker  0.0040252 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  31.87 
 
 		 273 aa  47.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  29.45 
 
 		 256 aa  47  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 		 273 aa  47.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0072  transport protein, putative  23.83 
 
 		 379 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0070  transport protein, putative  24.1 
 
 		 379 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1841  CAAX family protease  30 
 
 		 286 aa  47.8  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0074  transport protein, putative  24.1 
 
 		 379 aa  47.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000331098 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  31.46 
 
 		 448 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  32.14 
 
 		 527 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  32.14 
 
 		 527 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0019  Abortive infection protein  27.84 
 
 		 302 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1421  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 		 415 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  33.33 
 
 		 242 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  32.32 
 
 		 269 aa  46.6  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0673  abortive infection protein  26.36 
 
 		 253 aa  46.6  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0151  Abortive infection protein  34 
 
 		 276 aa  46.6  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  23.29 
 
 		 380 aa  45.8  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  37.84 
 
 		 241 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3240  abortive infection protein  30.21 
 
 		 255 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11341 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2922  abortive infection protein  32.22 
 
 		 195 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  29.91 
 
 		 337 aa  45.8  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0390  Abortive infection protein  32.53 
 
 		 321 aa  45.8  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  33.33 
 
 		 538 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  28.41 
 
 		 237 aa  45.8  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>