175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0052 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  684    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  93.52 
 
 
326 aa  639    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  91.41 
 
 
326 aa  628  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  77.54 
 
 
325 aa  545  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  67.18 
 
 
326 aa  471  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  67.08 
 
 
325 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  66.56 
 
 
326 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  65.53 
 
 
325 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  65.23 
 
 
325 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  65.53 
 
 
326 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  65.84 
 
 
325 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  66.15 
 
 
325 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  65.94 
 
 
326 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  66.15 
 
 
325 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  66.46 
 
 
325 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  64.62 
 
 
325 aa  461  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  64.91 
 
 
325 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  65.53 
 
 
325 aa  461  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  65.53 
 
 
325 aa  461  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  65.94 
 
 
326 aa  464  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  65.84 
 
 
325 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  65.22 
 
 
325 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  65.94 
 
 
325 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  65.84 
 
 
325 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  65.31 
 
 
325 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  64.62 
 
 
325 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  65.23 
 
 
325 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  64 
 
 
325 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  64 
 
 
325 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  64.29 
 
 
325 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  64.31 
 
 
325 aa  448  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  66.67 
 
 
319 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  63.08 
 
 
325 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  64.06 
 
 
325 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  64.06 
 
 
325 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  66.34 
 
 
316 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  64.38 
 
 
325 aa  443  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  61.8 
 
 
325 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  62.19 
 
 
323 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  64.38 
 
 
325 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  62.38 
 
 
325 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  62.85 
 
 
325 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  63.69 
 
 
325 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  63.19 
 
 
329 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  60.82 
 
 
325 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  61.18 
 
 
325 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  60.62 
 
 
325 aa  428  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  63.19 
 
 
326 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  60.94 
 
 
325 aa  425  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  60.31 
 
 
325 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  62.93 
 
 
326 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  65.26 
 
 
293 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  57.72 
 
 
327 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  57.54 
 
 
327 aa  378  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  57.54 
 
 
327 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  55 
 
 
323 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  57.1 
 
 
327 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  56.92 
 
 
327 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  56.62 
 
 
327 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  54.32 
 
 
325 aa  353  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  55.27 
 
 
325 aa  351  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  53.42 
 
 
325 aa  350  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  55.06 
 
 
325 aa  350  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  54.83 
 
 
325 aa  345  8.999999999999999e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  54.43 
 
 
325 aa  344  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  54.11 
 
 
325 aa  340  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  51.23 
 
 
327 aa  339  4e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  54.11 
 
 
325 aa  337  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  53.8 
 
 
325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  66.52 
 
 
238 aa  320  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  49.52 
 
 
328 aa  311  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  44.63 
 
 
370 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  51.18 
 
 
336 aa  300  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  45.86 
 
 
341 aa  296  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  46.43 
 
 
336 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  46.91 
 
 
347 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  52.22 
 
 
271 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  43.7 
 
 
341 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  43.11 
 
 
341 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  43.02 
 
 
344 aa  279  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  42.82 
 
 
341 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  43.6 
 
 
344 aa  275  9e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  42.12 
 
 
377 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  43.32 
 
 
370 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  45.87 
 
 
341 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  43.02 
 
 
344 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  42.56 
 
 
349 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  45.93 
 
 
329 aa  272  6e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  43.24 
 
 
345 aa  272  6e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  62.44 
 
 
208 aa  271  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  43.75 
 
 
345 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  43.31 
 
 
344 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  42.23 
 
 
347 aa  269  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  41.28 
 
 
344 aa  267  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  41.86 
 
 
344 aa  267  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  69.01 
 
 
186 aa  261  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  42.9 
 
 
324 aa  260  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  65.75 
 
 
186 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  65 
 
 
198 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  65 
 
 
198 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>