More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2814 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  100 
 
 		 177 aa  354  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  52.29 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  52.98 
 
 		 152 aa  157  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  41.34 
 
 		 178 aa  147  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  49.01 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  43.18 
 
 		 178 aa  144  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  46.2 
 
 		 177 aa  140  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  43.26 
 
 		 177 aa  140  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  41.14 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  41.72 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  45.03 
 
 		 200 aa  128  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  42.48 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  42.31 
 
 		 221 aa  125  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  38.71 
 
 		 219 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  39.87 
 
 		 235 aa  122  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  39.87 
 
 		 235 aa  120  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  42.58 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  37.09 
 
 		 213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  36.16 
 
 		 184 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  39.74 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  41.06 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  39.49 
 
 		 234 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  41.06 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  37.75 
 
 		 193 aa  114  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  39.74 
 
 		 191 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  42.38 
 
 		 187 aa  114  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  42.38 
 
 		 196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  36.94 
 
 		 220 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  38.41 
 
 		 191 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  40.26 
 
 		 195 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  38.41 
 
 		 186 aa  110  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  36.42 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  36.42 
 
 		 238 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  37.18 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  34.67 
 
 		 247 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  37.91 
 
 		 192 aa  103  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  37.91 
 
 		 192 aa  103  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  37.09 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  38.16 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  32.35 
 
 		 192 aa  99  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  37.91 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  36.18 
 
 		 190 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  31.71 
 
 		 192 aa  90.9  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  35.11 
 
 		 237 aa  88.6  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 193 aa  87.4  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  35.53 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  38.1 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  35.07 
 
 		 264 aa  86.3  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  38.46 
 
 		 253 aa  85.1  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  32.93 
 
 		 270 aa  84.3  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  38.21 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  36.88 
 
 		 410 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  36.88 
 
 		 410 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  36.5 
 
 		 417 aa  81.6  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  34.39 
 
 		 277 aa  80.9  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  39.83 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  42.06 
 
 		 419 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  34.4 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  35.94 
 
 		 276 aa  78.6  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  39.05 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  34.31 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  31.69 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  35.54 
 
 		 455 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33.11 
 
 		 396 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  35.54 
 
 		 455 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  29.14 
 
 		 324 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  31.69 
 
 		 270 aa  75.1  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  34.03 
 
 		 437 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  34.31 
 
 		 270 aa  75.1  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  35.46 
 
 		 411 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  30.9 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.55 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.19 
 
 		 422 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  31.9 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2488  polysaccharide export protein  29.89 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.19 
 
 		 446 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  36.22 
 
 		 427 aa  72.4  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  31.94 
 
 		 417 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  34.07 
 
 		 393 aa  71.2  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  31.54 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  36 
 
 		 422 aa  70.9  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  29.56 
 
 		 362 aa  70.9  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  28.49 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  33.56 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6263  polysaccharide export protein  31.61 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  33.8 
 
 		 398 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  33.83 
 
 		 388 aa  69.3  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  32.47 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  39.77 
 
 		 442 aa  69.3  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5118  polysaccharide export protein  31.69 
 
 		 348 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  normal  0.024948 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  32.59 
 
 		 264 aa  68.2  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  28.65 
 
 		 317 aa  67.4  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4235  polysaccharide export protein  29.73 
 
 		 205 aa  67  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.694304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  29.63 
 
 		 347 aa  67  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  30.67 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  35.19 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  30.3 
 
 		 425 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  30.67 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  35.19 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>