109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2748 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 		 314 aa  619  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  71.14 
 
 		 320 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  52.6 
 
 		 324 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  49.67 
 
 		 329 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  49.66 
 
 		 323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  49.66 
 
 		 323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  52.61 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  45.48 
 
 		 323 aa  265  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  46.45 
 
 		 325 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  46.56 
 
 		 321 aa  258  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  48.73 
 
 		 322 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  49.09 
 
 		 322 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  49.09 
 
 		 322 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  35.29 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  37.79 
 
 		 353 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  36.45 
 
 		 365 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.16 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.39 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  36.14 
 
 		 361 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  36.3 
 
 		 340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  37 
 
 		 363 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  35.11 
 
 		 341 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  39.13 
 
 		 331 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  39.67 
 
 		 331 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  34.64 
 
 		 319 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  34.53 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  34.29 
 
 		 346 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  35.51 
 
 		 363 aa  139  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.48 
 
 		 324 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 332 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  33.9 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  33.7 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4061  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  37.87 
 
 		 356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3921  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.09 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 335 aa  122  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.39 
 
 		 359 aa  122  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.94 
 
 		 352 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4028  glycosyl hydrolase, BNR repeat  37.24 
 
 		 355 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0574682  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0646  hypothetical protein  31.63 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104627  normal  0.241315 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  30.62 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  31.46 
 
 		 354 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  31.66 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.22 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  30.63 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  34 
 
 		 368 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  33.21 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  29.28 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2435  BNR repeat-containing protein  29.64 
 
 		 338 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.724955  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  29.64 
 
 		 338 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  29.64 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.34 
 
 		 334 aa  99.8  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  29.64 
 
 		 337 aa  97.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  31.75 
 
 		 897 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  31.28 
 
 		 661 aa  84  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3229  BNR domain-containing protein  31.75 
 
 		 338 aa  75.9  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  29.7 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.41 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  32.89 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.34 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.16 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  27.94 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  24.77 
 
 		 698 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.17 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  31.39 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 2082 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  27.49 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  26.69 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3430  BNR repeat-containing protein  22.83 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0324966  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3503  Ycf48-like protein  30.6 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  30.41 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4958  hypothetical protein  27.04 
 
 		 357 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.75067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1157  hypothetical protein  27.59 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  25 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  25 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  27.56 
 
 		 339 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  24.26 
 
 		 742 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  29.92 
 
 		 334 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.31 
 
 		 321 aa  52.8  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  31.11 
 
 		 421 aa  50.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03221  Ycf48-like protein  29.89 
 
 		 339 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25281  Ycf48-like protein  30.47 
 
 		 335 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03201  Ycf48-like protein  31.71 
 
 		 338 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0298  Ycf48-like protein  32.33 
 
 		 338 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1238  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47413  predicted protein  26.32 
 
 		 408 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  22.75 
 
 		 759 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  28.29 
 
 		 614 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  27.01 
 
 		 338 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3373  oxidoreductase  23.68 
 
 		 372 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3319  Uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  30.99 
 
 		 1120 aa  46.6  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 1021 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03191  Ycf48-like protein  30.89 
 
 		 338 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>