More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1653 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 424 aa  863    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  57.56 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  57.56 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  56.5 
 
 		 421 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  57.07 
 
 		 462 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  57.07 
 
 		 413 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  57.34 
 
 		 411 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  51.88 
 
 		 455 aa  404  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  51.88 
 
 		 417 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  52.69 
 
 		 415 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  47.42 
 
 		 427 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  51.34 
 
 		 445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  50.13 
 
 		 445 aa  356  5e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  51.76 
 
 		 440 aa  354  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  50.54 
 
 		 438 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  50.67 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  50.67 
 
 		 438 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  49.46 
 
 		 448 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  49.46 
 
 		 438 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  47.34 
 
 		 425 aa  342  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  46.3 
 
 		 398 aa  341  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  48.92 
 
 		 448 aa  338  9e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  46.58 
 
 		 514 aa  338  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  46.34 
 
 		 409 aa  333  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  46.6 
 
 		 381 aa  333  4e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  46.93 
 
 		 438 aa  331  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  48.77 
 
 		 432 aa  330  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  47.55 
 
 		 438 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  45.53 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  46.39 
 
 		 398 aa  324  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  46.6 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  49.6 
 
 		 418 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  46.52 
 
 		 398 aa  323  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  48.78 
 
 		 430 aa  322  9.000000000000001e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  45.8 
 
 		 398 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  41.33 
 
 		 413 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  45.53 
 
 		 398 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  45.03 
 
 		 404 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  44.83 
 
 		 419 aa  318  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  45.6 
 
 		 413 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  45.17 
 
 		 398 aa  315  8e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  46.59 
 
 		 434 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  45.69 
 
 		 418 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  47.14 
 
 		 413 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  42.26 
 
 		 409 aa  312  7.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  46.75 
 
 		 423 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1864  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  46.54 
 
 		 370 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.498098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  46.51 
 
 		 392 aa  309  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  47.06 
 
 		 400 aa  308  9e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  44.36 
 
 		 412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  46.05 
 
 		 422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  43.24 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  43.24 
 
 		 405 aa  306  7e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  44.09 
 
 		 412 aa  305  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  43.73 
 
 		 720 aa  305  8.000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  43.2 
 
 		 457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  47.72 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  43.47 
 
 		 470 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  43.09 
 
 		 417 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  45.99 
 
 		 400 aa  299  5e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  46.19 
 
 		 430 aa  299  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  45.6 
 
 		 393 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  44.69 
 
 		 400 aa  298  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0070  transglycosylase, putative  43.57 
 
 		 408 aa  298  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18416  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  45.41 
 
 		 393 aa  296  6e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  41.67 
 
 		 464 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  41.13 
 
 		 451 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  43.86 
 
 		 405 aa  293  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  43.01 
 
 		 466 aa  292  6e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  43.01 
 
 		 474 aa  292  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  41.16 
 
 		 418 aa  291  1e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  42.98 
 
 		 464 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  42.55 
 
 		 454 aa  289  8e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  42.86 
 
 		 405 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  40.54 
 
 		 461 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  44.11 
 
 		 470 aa  286  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 469 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  41.71 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  44.44 
 
 		 407 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  44.11 
 
 		 481 aa  283  6.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  40.11 
 
 		 434 aa  282  8.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0286  lytic murein transglycosylase  42.55 
 
 		 474 aa  280  3e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  41.97 
 
 		 491 aa  279  8e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3846  lytic murein transglycosylase  41.49 
 
 		 416 aa  278  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.977376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  40.98 
 
 		 490 aa  277  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  42.65 
 
 		 486 aa  277  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  43.88 
 
 		 390 aa  276  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  41.69 
 
 		 407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  41.42 
 
 		 407 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  37.35 
 
 		 445 aa  272  9e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  37.66 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  38.42 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  37.97 
 
 		 411 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  37.97 
 
 		 436 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  38.67 
 
 		 377 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  41.22 
 
 		 429 aa  266  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  37.5 
 
 		 396 aa  263  6e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  40.79 
 
 		 406 aa  261  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0039  lytic murein transglycosylase  45.74 
 
 		 396 aa  259  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  40.82 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>