56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0946 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0946  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  688    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000225711 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1380  hypothetical protein  37.25 
 
 		 225 aa  161  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0126291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1378  hypothetical protein  29.06 
 
 		 208 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0809493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  39.47 
 
 		 757 aa  85.9  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  36.79 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  30.71 
 
 		 713 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  40.21 
 
 		 1041 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  41.67 
 
 		 1749 aa  68.2  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  38.38 
 
 		 482 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  35.09 
 
 		 1263 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.63 
 
 		 1107 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  36.14 
 
 		 1015 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  39.02 
 
 		 937 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  37.65 
 
 		 892 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  35.96 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  39.02 
 
 		 937 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  34.96 
 
 		 867 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  35.11 
 
 		 886 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  29.51 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0408  hypothetical protein  21.51 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  41.18 
 
 		 508 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  36.84 
 
 		 467 aa  57  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1531  predicted protein  32.33 
 
 		 447 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.486556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  30.47 
 
 		 863 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1744 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.81 
 
 		 476 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  31.96 
 
 		 242 aa  53.9  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1475  hypothetical protein  32.41 
 
 		 225 aa  53.9  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.661845  normal  0.169207 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  30.63 
 
 		 675 aa  52.8  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  29.46 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  36.47 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  31.03 
 
 		 1024 aa  49.7  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  36.84 
 
 		 478 aa  49.7  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4538  leucine-rich repeat protein  37.35 
 
 		 225 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  36.23 
 
 		 484 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  26.67 
 
 		 761 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  36.14 
 
 		 447 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  36.14 
 
 		 447 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  28 
 
 		 149 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  29.29 
 
 		 580 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  35.96 
 
 		 490 aa  47.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2065  leucine-rich repeat protein  39.68 
 
 		 108 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  31.76 
 
 		 1088 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  26.44 
 
 		 2132 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  28.57 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  30.3 
 
 		 802 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 		 436 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  25.77 
 
 		 472 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  25.58 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  30.21 
 
 		 647 aa  44.3  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  32.28 
 
 		 1481 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  33.73 
 
 		 447 aa  43.9  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  25 
 
 		 2324 aa  43.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  32.18 
 
 		 448 aa  43.1  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  33.73 
 
 		 446 aa  43.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  33.73 
 
 		 421 aa  42.7  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>