More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1923 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  740    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  37.01 
 
 		 359 aa  260  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  36.44 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  35.65 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  35.57 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  35.57 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  35.18 
 
 		 359 aa  223  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  37.11 
 
 		 359 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  32 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  29.44 
 
 		 360 aa  185  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  28.05 
 
 		 792 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  26.63 
 
 		 360 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  27.5 
 
 		 359 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  28.02 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  27.96 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  24.58 
 
 		 359 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  24.79 
 
 		 356 aa  120  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  26.12 
 
 		 358 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  24.5 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  24.66 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  23.66 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  25.43 
 
 		 370 aa  116  7.999999999999999e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  25.41 
 
 		 365 aa  115  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  23.58 
 
 		 356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  25.53 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  24.8 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  23.48 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0375  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 361 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0887769 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  25.85 
 
 		 354 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  25.28 
 
 		 359 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  26.67 
 
 		 360 aa  106  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  24.59 
 
 		 360 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  25.47 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  22.29 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  24.29 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  24.85 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  26.63 
 
 		 358 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  24.13 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  24.05 
 
 		 374 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  25.99 
 
 		 389 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  24.16 
 
 		 360 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  22.16 
 
 		 355 aa  96.3  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  21.43 
 
 		 353 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1403  permease YjgP/YjgQ family protein  25.72 
 
 		 360 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  24.92 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  22.49 
 
 		 354 aa  93.6  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 		 360 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  24.01 
 
 		 355 aa  93.2  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  22.44 
 
 		 356 aa  93.2  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 		 360 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  22.77 
 
 		 434 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  23.37 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  22.03 
 
 		 358 aa  89.7  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  22.03 
 
 		 358 aa  89.7  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  22.03 
 
 		 358 aa  89.7  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  24.4 
 
 		 392 aa  89.4  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  22.04 
 
 		 360 aa  89  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  25.75 
 
 		 360 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  24.87 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  23.26 
 
 		 352 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  23.23 
 
 		 352 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3555  permease YjgP/YjgQ family protein  22.6 
 
 		 356 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  22.87 
 
 		 1096 aa  87  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  22.9 
 
 		 352 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4818  putative permease  21.35 
 
 		 360 aa  87.4  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339649  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  22.92 
 
 		 352 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  22.92 
 
 		 352 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  22.32 
 
 		 356 aa  87  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  22.92 
 
 		 352 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  22.9 
 
 		 352 aa  87  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  22.9 
 
 		 352 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4743  putative permease  21.35 
 
 		 360 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000687106  normal  0.744445 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04128  conserved inner membrane protein  21.35 
 
 		 360 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00895829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  21.35 
 
 		 360 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00436584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4835  putative permease  21.35 
 
 		 360 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000478457  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5784  putative permease  21.35 
 
 		 360 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000901519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  22.54 
 
 		 401 aa  86.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  20.62 
 
 		 401 aa  86.7  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3750  permease YjgP/YjgQ family protein  21.35 
 
 		 360 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000963246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4518  putative permease  21.35 
 
 		 360 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136034  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04092  hypothetical protein  21.35 
 
 		 360 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  22.81 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  22.96 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  22.6 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  23.93 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  20.65 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  24.25 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  26.6 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  22.9 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  24.46 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  24.73 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4735  inner membrane protein YjgQ  21.35 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0130058  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4828  inner membrane protein YjgQ  21.35 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  24.18 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  26.02 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4884  hypothetical protein  21.35 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4765  inner membrane protein YjgQ  21.35 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000537326  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4865  inner membrane protein YjgQ  21.35 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000705517  normal  0.203916 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  21.78 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  22.22 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>