244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0620 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  100 
 
 		 398 aa  810    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  51.21 
 
 		 376 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  49.46 
 
 		 375 aa  362  9e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  52.55 
 
 		 378 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  51.74 
 
 		 378 aa  356  5e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  51.24 
 
 		 376 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  45.45 
 
 		 451 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  47.31 
 
 		 375 aa  323  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  43.6 
 
 		 396 aa  266  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  40.38 
 
 		 382 aa  259  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  40.47 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  39.45 
 
 		 377 aa  236  7e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  36.76 
 
 		 379 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  33.51 
 
 		 376 aa  225  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  36.53 
 
 		 392 aa  218  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  34.72 
 
 		 398 aa  216  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  38.26 
 
 		 385 aa  211  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  32.03 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  29.95 
 
 		 378 aa  205  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  34.03 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  33.25 
 
 		 375 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  31.38 
 
 		 382 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  32.45 
 
 		 379 aa  196  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  33.25 
 
 		 379 aa  196  6e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  32.53 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  38.33 
 
 		 323 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  42.86 
 
 		 320 aa  193  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  38.26 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  39.92 
 
 		 315 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  37.32 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  39.83 
 
 		 319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  39.27 
 
 		 319 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  31.4 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  28.61 
 
 		 371 aa  159  9e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  32.26 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  32.26 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  37.55 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  36.89 
 
 		 328 aa  131  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  34.58 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  35.83 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  34.3 
 
 		 303 aa  120  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.2 
 
 		 618 aa  119  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  26.34 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0208  protein of unknown function DUF362  30.15 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  31.67 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  31.67 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  31.67 
 
 		 293 aa  99.8  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  32.6 
 
 		 326 aa  99.4  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  32.11 
 
 		 306 aa  97.4  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  31.05 
 
 		 304 aa  96.7  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  31.91 
 
 		 294 aa  96.3  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  31.67 
 
 		 306 aa  93.2  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  32.42 
 
 		 293 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  31.78 
 
 		 318 aa  90.5  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  26.34 
 
 		 347 aa  89.7  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  30.83 
 
 		 282 aa  88.2  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  30 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  29.01 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  23.89 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  28.05 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  25.7 
 
 		 331 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  29.13 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  27.27 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  24.61 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  22.43 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  26.84 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  26.38 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0562  protein of unknown function DUF362  25.38 
 
 		 479 aa  66.6  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  26.74 
 
 		 505 aa  63.2  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  28.37 
 
 		 305 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  26.52 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  26.74 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2040  hypothetical protein  29.28 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  25.35 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0359  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 137 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.389244  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0079  trichloroethene reductive dehalogenase  28.77 
 
 		 554 aa  53.9  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00164109  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3796  hypothetical protein  25.85 
 
 		 517 aa  53.5  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0524079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2631  Ferredoxin hydrogenase  29.67 
 
 		 490 aa  53.1  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000219307  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0579  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.86 
 
 		 62 aa  52.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1973  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  38 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.07 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000589755  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1376  pyruvate synthase subunit porD  36.07 
 
 		 102 aa  52.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.010194  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  40.35 
 
 		 596 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0386  hypothetical protein  38.71 
 
 		 434 aa  51.2  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.590413 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 368 aa  50.8  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  23.14 
 
 		 308 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  29.86 
 
 		 263 aa  50.4  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0411  Ferredoxin hydrogenase  28.09 
 
 		 531 aa  50.4  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0687694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0889  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30 
 
 		 357 aa  50.4  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000133582  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02060  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 		 571 aa  49.7  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1277  Fe-hydrogenase large subunit family protein  28.09 
 
 		 493 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000478337  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  22.8 
 
 		 377 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.01191 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2729  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.9 
 
 		 125 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.396003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  40 
 
 		 598 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2145  Fe-S cluster domain-containing protein  42 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.84 
 
 		 292 aa  48.9  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2477  glycyl-radical enzyme activating protein family  32.31 
 
 		 310 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.731109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2192  glycyl-radical activating family protein  36.92 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0607  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  37.88 
 
 		 264 aa  48.9  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  36.21 
 
 		 624 aa  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>