More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0245 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  100 
 
 		 171 aa  353  5.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  56.13 
 
 		 171 aa  191  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  55.77 
 
 		 167 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  55.77 
 
 		 172 aa  181  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  58.39 
 
 		 172 aa  180  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  57.76 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  50.61 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  58.13 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  50 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  54.09 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3216  peptide deformylase  58.39 
 
 		 166 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0170058  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  50.3 
 
 		 171 aa  171  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  49.7 
 
 		 171 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  49.7 
 
 		 171 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  50.62 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  51.52 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  50.62 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  50.62 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  49.08 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  47.85 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  48.47 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  48.47 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  47.62 
 
 		 178 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  49.09 
 
 		 167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  49.11 
 
 		 171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  47.27 
 
 		 169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  47.34 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  50.87 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  49.09 
 
 		 167 aa  160  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  46.51 
 
 		 187 aa  159  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  48.19 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  48.19 
 
 		 181 aa  158  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  47.59 
 
 		 167 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  48.19 
 
 		 167 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  47.59 
 
 		 167 aa  157  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  47.59 
 
 		 167 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  47.59 
 
 		 167 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  44.97 
 
 		 170 aa  157  7e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  50.3 
 
 		 168 aa  157  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  45.24 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  47.65 
 
 		 177 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  45.24 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  45.56 
 
 		 170 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  45.78 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  45.78 
 
 		 191 aa  155  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  46.99 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  46.99 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  46.99 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  46.99 
 
 		 179 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  45.78 
 
 		 169 aa  155  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  45.18 
 
 		 170 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  45.56 
 
 		 174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  46.78 
 
 		 172 aa  154  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  46.99 
 
 		 179 aa  154  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  46.99 
 
 		 179 aa  154  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  47.56 
 
 		 167 aa  154  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  46.99 
 
 		 167 aa  153  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  46.99 
 
 		 179 aa  153  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  47.62 
 
 		 168 aa  153  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  46.75 
 
 		 168 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  48.19 
 
 		 178 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  50 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  46.95 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  46.15 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  45.09 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  46.75 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  47.02 
 
 		 168 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  47.02 
 
 		 168 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  47.34 
 
 		 168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  47.62 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  47.31 
 
 		 170 aa  151  5e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  46.99 
 
 		 171 aa  150  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  43.2 
 
 		 187 aa  150  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  43.2 
 
 		 187 aa  150  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  49.04 
 
 		 170 aa  150  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  43.37 
 
 		 170 aa  149  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  44.97 
 
 		 171 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  46.71 
 
 		 171 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  46.39 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  44.38 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  42.35 
 
 		 174 aa  150  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2039  peptide deformylase  46.39 
 
 		 184 aa  149  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  46.06 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  44.85 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3350  peptide deformylase  50.9 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954138  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  45.88 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  46.71 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  46.06 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  45.51 
 
 		 169 aa  149  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  46.43 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  45.03 
 
 		 169 aa  147  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  48.81 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  43.79 
 
 		 171 aa  147  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4240  peptide deformylase  48.54 
 
 		 173 aa  147  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  43.53 
 
 		 169 aa  147  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  45.35 
 
 		 175 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  46.34 
 
 		 167 aa  147  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3968  peptide deformylase  42.77 
 
 		 170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  47.56 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  43.01 
 
 		 188 aa  146  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>