More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1365 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  52.24 
 
 
949 aa  1033  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  52.21 
 
 
944 aa  1030  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  51.22 
 
 
944 aa  1004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  52.27 
 
 
943 aa  1026  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  53.04 
 
 
950 aa  1050  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  49.79 
 
 
947 aa  941  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  52.51 
 
 
949 aa  1041  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  50.52 
 
 
974 aa  983  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  50.98 
 
 
969 aa  931  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  51.85 
 
 
945 aa  995  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  52.99 
 
 
944 aa  1048  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  52.83 
 
 
950 aa  1043  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  46.95 
 
 
952 aa  897  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  100 
 
 
958 aa  1983  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  52.83 
 
 
950 aa  1044  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  48.9 
 
 
950 aa  917  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  52.32 
 
 
944 aa  1011  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  62.09 
 
 
945 aa  1192  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  52.41 
 
 
949 aa  1040  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  51.89 
 
 
944 aa  995  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  49.1 
 
 
947 aa  923  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  52.65 
 
 
945 aa  1043  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  52.41 
 
 
949 aa  1038  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  53.38 
 
 
959 aa  1025  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  33.44 
 
 
921 aa  511  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  33.92 
 
 
954 aa  497  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  32.6 
 
 
929 aa  475  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  32.6 
 
 
949 aa  475  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  32.48 
 
 
947 aa  469  1e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  30.9 
 
 
943 aa  445  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  31.26 
 
 
960 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  31.5 
 
 
962 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  31.26 
 
 
930 aa  421  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  31.92 
 
 
959 aa  414  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  31.06 
 
 
949 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  30.14 
 
 
952 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  30.46 
 
 
956 aa  407  1e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  29.68 
 
 
910 aa  398  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  29.63 
 
 
967 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  30.01 
 
 
901 aa  349  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  30.2 
 
 
903 aa  338  2e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  30.32 
 
 
904 aa  331  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  40.1 
 
 
458 aa  319  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  40.1 
 
 
458 aa  319  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  40.1 
 
 
458 aa  320  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  26.46 
 
 
954 aa  316  1e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  26.05 
 
 
945 aa  284  5e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  25.2 
 
 
896 aa  277  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  37.93 
 
 
470 aa  271  6e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  25.41 
 
 
937 aa  269  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  25.67 
 
 
929 aa  260  8e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  39.22 
 
 
429 aa  257  7e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  26.25 
 
 
919 aa  246  1e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  32.3 
 
 
440 aa  246  1e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3948  peptidase M16 domain-containing protein  37.79 
 
 
429 aa  245  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425388  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0404  peptidase M16 domain protein  36.6 
 
 
442 aa  239  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2363  putative zinc proteinase  35.83 
 
 
447 aa  239  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  25.61 
 
 
934 aa  236  2e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  26.23 
 
 
918 aa  235  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0871  peptidase M16 domain protein  36.55 
 
 
423 aa  234  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  31.69 
 
 
440 aa  234  7e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  26.21 
 
 
948 aa  233  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  34.52 
 
 
427 aa  231  5e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  31.1 
 
 
422 aa  226  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  24.56 
 
 
876 aa  224  5e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  26.02 
 
 
949 aa  219  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  26.66 
 
 
912 aa  218  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  24.71 
 
 
928 aa  213  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  25.03 
 
 
912 aa  210  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  24.51 
 
 
921 aa  205  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  24.33 
 
 
957 aa  205  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  32.62 
 
 
443 aa  203  1e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  24.39 
 
 
942 aa  202  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  30.62 
 
 
442 aa  201  4e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  31.59 
 
 
414 aa  201  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  32.38 
 
 
443 aa  200  1e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  33.58 
 
 
411 aa  199  1e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  30.38 
 
 
459 aa  199  2e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  32.38 
 
 
443 aa  199  2e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  31.52 
 
 
443 aa  199  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  32.29 
 
 
464 aa  198  4e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  31.73 
 
 
441 aa  198  5e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2951  peptidase M16 domain protein  36.22 
 
 
413 aa  198  5e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  32.07 
 
 
443 aa  197  7e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  32.54 
 
 
443 aa  197  8e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  33.99 
 
 
413 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  31.73 
 
 
457 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  32.26 
 
 
461 aa  196  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  31.83 
 
 
443 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2922  peptidase M16 domain protein  24.08 
 
 
903 aa  196  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.179553  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  31.83 
 
 
443 aa  196  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  31.41 
 
 
457 aa  194  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  31.59 
 
 
443 aa  194  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  30.94 
 
 
443 aa  193  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  32.26 
 
 
469 aa  193  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  31.95 
 
 
453 aa  193  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  32.92 
 
 
441 aa  192  3e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  24 
 
 
853 aa  192  3e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  31.57 
 
 
428 aa  192  3e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  31.28 
 
 
476 aa  192  3e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>