More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4576 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02629  (p)ppGpp synthetase I/GTP pyrophosphokinase  46.62 
 
 		 744 aa  701    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000829976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02591  hypothetical protein  46.62 
 
 		 744 aa  701    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000104096  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0904  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.62 
 
 		 744 aa  701    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000660798  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2922  GDP/GTP pyrophosphokinase  46.62 
 
 		 744 aa  700    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000016084  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1656  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  87.55 
 
 		 746 aa  1355    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.764333  normal  0.672411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4576  GTP pyrophosphokinase  100 
 
 		 747 aa  1534    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0815  GDP/GTP pyrophosphokinase  46.3 
 
 		 745 aa  710    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4115  GTP pyrophosphokinase  48.16 
 
 		 737 aa  698    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1202  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  51.47 
 
 		 734 aa  706    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000141345  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3455  GTP pyrophosphokinase  52.21 
 
 		 735 aa  748    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1694  GTP pyrophosphokinase  86.69 
 
 		 744 aa  1337    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37060  RelA/SpoT protein  83.42 
 
 		 749 aa  1287    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00582579  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0849  GDP/GTP pyrophosphokinase  46.83 
 
 		 746 aa  700    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000221192  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3236  GDP/GTP pyrophosphokinase  46.8 
 
 		 743 aa  701    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000465507  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1413  GTP pyrophosphokinase  48.07 
 
 		 734 aa  734    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1571  GTP pyrophosphokinase  48.07 
 
 		 734 aa  736    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3695  RelA/SpoT protein  86.88 
 
 		 747 aa  1343    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120676  hitchhiker  0.00160014 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0343  putative RelA/SpoT family protein  45.3 
 
 		 846 aa  648    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000094604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3115  GDP/GTP pyrophosphokinase  46.87 
 
 		 744 aa  703    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0106723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3548  GDP/GTP pyrophosphokinase  47.42 
 
 		 745 aa  713    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000488354  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1287  GTP diphosphokinase  49.78 
 
 		 735 aa  713    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000126799  unclonable  0.000000000190177 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03528  GTP pyrophosphokinase  45.15 
 
 		 739 aa  679    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4217  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  87.68 
 
 		 747 aa  1365    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.630753  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2928  GDP/GTP pyrophosphokinase  46.62 
 
 		 744 aa  701    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000188713  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3389  GDP/GTP pyrophosphokinase  47.61 
 
 		 744 aa  714    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000633248  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2029  GTP pyrophosphokinase  45.43 
 
 		 738 aa  681    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178935  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3097  GDP/GTP pyrophosphokinase  46.87 
 
 		 744 aa  703    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000040075  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2518  GTP pyrophosphokinase  47.32 
 
 		 745 aa  679    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.326663  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2113  GTP diphosphokinase  48.14 
 
 		 770 aa  660    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.978919  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3146  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  51.69 
 
 		 736 aa  734    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000043894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3162  GDP/GTP pyrophosphokinase  46.74 
 
 		 744 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00447218  normal  0.0412564 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1253  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  53.94 
 
 		 749 aa  841    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000616192  normal  0.537629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1217  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  87.68 
 
 		 746 aa  1354    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.212214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1257  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  87.55 
 
 		 746 aa  1353    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.648227  normal  0.0100627 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2238  GTP diphosphokinase  57.43 
 
 		 746 aa  864    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.338893  hitchhiker  0.000119577 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1182  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  49.63 
 
 		 735 aa  689    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000045957  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1298  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  48.32 
 
 		 740 aa  642    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000189131  hitchhiker  0.0061753 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3449  GDP/GTP pyrophosphokinase  48.08 
 
 		 744 aa  706    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000378764  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1193  RelA/SpoT family protein  51.55 
 
 		 735 aa  741    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000349735  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1638  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  62.92 
 
 		 750 aa  959    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34257  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0377  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  45.56 
 
 		 846 aa  649    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000730209  normal  0.0150948 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3089  GDP/GTP pyrophosphokinase  46.75 
 
 		 744 aa  702    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000014869  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002504  GTP pyrophosphokinase (p)ppGpp synthetase I  44.68 
 
 		 739 aa  675    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000545051  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0792  GDP/GTP pyrophosphokinase  47.33 
 
 		 743 aa  700    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000258134  normal  0.259843 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3707  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  50.22 
 
 		 720 aa  706    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000687808  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3178  GDP/GTP pyrophosphokinase  46.87 
 
 		 744 aa  703    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00141228  normal  0.185279 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4044  GDP/GTP pyrophosphokinase  46.62 
 
 		 744 aa  701    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000409177  normal  0.332873 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0095  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  47.02 
 
 		 745 aa  699    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000291848  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0983  GDP/GTP pyrophosphokinase  48.08 
 
 		 744 aa  706    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1111  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  52.06 
 
 		 735 aa  744    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000170035  normal  0.84646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1177  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  52.06 
 
 		 735 aa  744    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000122235  normal  0.0382614 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1097  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.36 
 
 		 735 aa  701    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00537939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1049  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  50.59 
 
 		 756 aa  724    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000145818  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03401  GTP pyrophosphokinase  48.04 
 
 		 727 aa  683    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00113456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52180  GTP pyrophosphokinase  99.6 
 
 		 747 aa  1526    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00224344  normal  0.0200902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3276  GDP/GTP pyrophosphokinase  46.74 
 
 		 744 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00140611  normal  0.0304818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4062  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  87.55 
 
 		 746 aa  1354    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.733474  normal  0.507158 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0928  GDP/GTP pyrophosphokinase  46.62 
 
 		 744 aa  701    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000382583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3319  GDP/GTP pyrophosphokinase  48.08 
 
 		 744 aa  706    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000026158  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1735  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  85.92 
 
 		 747 aa  1339    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1225  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  51.69 
 
 		 736 aa  735    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000385822  hitchhiker  0.0000000464674 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1533  RelA/SpoT family protein  47.14 
 
 		 714 aa  647    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000577209  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2765  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  51.77 
 
 		 735 aa  740    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000517482  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1111  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  51.92 
 
 		 735 aa  742    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000524023  normal  0.850048 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3353  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.13 
 
 		 735 aa  715    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000634706  hitchhiker  0.000162185 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3144  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  51.77 
 
 		 735 aa  737    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000386215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3088  GDP/GTP pyrophosphokinase  46.62 
 
 		 744 aa  701    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000221392  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1033  GTP diphosphokinase  47.66 
 
 		 734 aa  707    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0165822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3289  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  51.69 
 
 		 736 aa  735    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000182723  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0530  (p)ppGpp synthetase I and guanosine-3',5'-bis pyrophosphate 3'-pyrophosphohydrolase  50.95 
 
 		 737 aa  710    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.000055023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1462  GTP pyrophosphokinase  47 
 
 		 714 aa  644    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00122903  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2238  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  63.94 
 
 		 745 aa  983    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2505  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  47.63 
 
 		 729 aa  634  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2827  RelA/SpoT protein  43.82 
 
 		 740 aa  625  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00393712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2280  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.03 
 
 		 734 aa  624  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122723  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1159  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  45.03 
 
 		 742 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0383  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.52 
 
 		 897 aa  617  1e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000110921  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0998  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.35 
 
 		 721 aa  609  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1978  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.31 
 
 		 741 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.699321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_5  relA/spoT protein, GTP pyrophosphokinase  45.73 
 
 		 728 aa  607  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1274  RelA/SpoT protein  45.09 
 
 		 741 aa  608  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266642  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1300  RelA/SpoT protein  45.15 
 
 		 714 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00320424  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1740  metal dependent phosphohydrolase  47.16 
 
 		 736 aa  608  9.999999999999999e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1559  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.17 
 
 		 746 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0005  GTP pyrophosphokinase  45.22 
 
 		 728 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1648  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.68 
 
 		 741 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0787569 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2597  GTP pyrophosphokinase  44.65 
 
 		 725 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1576  GTP pyrophosphokinase  45.38 
 
 		 746 aa  601  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0005  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.22 
 
 		 728 aa  602  1e-170  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1098  GTP pyrophosphokinase  44.22 
 
 		 745 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537802  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1733  GTP diphosphokinase  44.37 
 
 		 745 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1542  GTP pyrophosphokinase  44.22 
 
 		 745 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1887  GTP pyrophosphokinase  44.37 
 
 		 716 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1709  GTP diphosphokinase  44.37 
 
 		 745 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1780  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.51 
 
 		 744 aa  598  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0214553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0960  GTP pyrophosphokinase  44.08 
 
 		 745 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00215739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0204  GTP pyrophosphokinase  44.08 
 
 		 745 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0162013  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1052  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.99 
 
 		 733 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1398  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.82 
 
 		 739 aa  592  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000892312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1370  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  46.26 
 
 		 747 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117046  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>