73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1131 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  100 
 
 		 371 aa  733    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  88.54 
 
 		 384 aa  627  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  59.8 
 
 		 385 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  54.43 
 
 		 383 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12261  porin  50.74 
 
 		 399 aa  315  9e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  51.6 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  47.52 
 
 		 449 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12251  porin  43.04 
 
 		 369 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  39.65 
 
 		 440 aa  192  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  35.45 
 
 		 437 aa  185  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  32.1 
 
 		 432 aa  176  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  31.41 
 
 		 432 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  31.89 
 
 		 426 aa  159  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  31.52 
 
 		 415 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  31.78 
 
 		 450 aa  136  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  31.22 
 
 		 414 aa  135  8e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  32.25 
 
 		 431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  32.01 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  29.07 
 
 		 514 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  28.84 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  27.92 
 
 		 515 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  28.43 
 
 		 524 aa  100  6e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  28.57 
 
 		 328 aa  99.8  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  29.43 
 
 		 510 aa  99.4  9e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  26.97 
 
 		 515 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  27.87 
 
 		 513 aa  94.7  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  29.69 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  28.08 
 
 		 543 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  27.68 
 
 		 335 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  28.2 
 
 		 333 aa  86.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  27.68 
 
 		 531 aa  86.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  27.68 
 
 		 336 aa  85.9  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  26.73 
 
 		 518 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  26.64 
 
 		 561 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  26.6 
 
 		 500 aa  80.1  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  25.99 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  26.17 
 
 		 528 aa  77  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  26.4 
 
 		 555 aa  76.6  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  27.52 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  32.16 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  24.22 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  26.94 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  32.63 
 
 		 639 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  28.74 
 
 		 578 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  26 
 
 		 518 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  33.08 
 
 		 589 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  31.65 
 
 		 491 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  31.76 
 
 		 563 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  30 
 
 		 550 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  34.31 
 
 		 543 aa  53.9  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  31.58 
 
 		 544 aa  53.9  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  26.37 
 
 		 531 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  33.09 
 
 		 548 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  32.91 
 
 		 658 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  26.23 
 
 		 574 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  33.06 
 
 		 533 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  26.6 
 
 		 581 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  26.6 
 
 		 581 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  33.33 
 
 		 561 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  30.67 
 
 		 624 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  33.83 
 
 		 542 aa  47  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  34.09 
 
 		 551 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  31.82 
 
 		 529 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  27.97 
 
 		 600 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  29.7 
 
 		 530 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  31.86 
 
 		 572 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  36.9 
 
 		 641 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  33.62 
 
 		 539 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  28.85 
 
 		 581 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  66.67 
 
 		 188 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  36.17 
 
 		 568 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  32.35 
 
 		 606 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  36.17 
 
 		 622 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>