97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46582 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46582  predicted protein  100 
 
 		 561 aa  1167    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  31.55 
 
 		 1063 aa  187  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.76 
 
 		 1033 aa  180  5.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  28.03 
 
 		 1049 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119488  Beta-galactosidase, putative  26.05 
 
 		 1164 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873023  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  29.13 
 
 		 1020 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  27.29 
 
 		 1129 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  25.31 
 
 		 1455 aa  163  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  26.28 
 
 		 1028 aa  158  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  29.48 
 
 		 1043 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  27.12 
 
 		 1041 aa  156  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.04 
 
 		 1026 aa  153  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  27.94 
 
 		 1035 aa  152  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  26.55 
 
 		 1044 aa  152  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  24.66 
 
 		 1024 aa  150  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  27.76 
 
 		 1031 aa  149  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1768  beta-D-galactosidase  25.59 
 
 		 1043 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.035592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  27.16 
 
 		 1043 aa  144  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  25.32 
 
 		 1032 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  26.94 
 
 		 1084 aa  140  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  24.71 
 
 		 1112 aa  139  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  27.11 
 
 		 1036 aa  137  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.45 
 
 		 1013 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  26.33 
 
 		 1029 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  26.89 
 
 		 1084 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  25.55 
 
 		 1094 aa  133  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  22.91 
 
 		 1036 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.08 
 
 		 1018 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  26.37 
 
 		 1079 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25 
 
 		 1033 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1362  beta-D-galactosidase  24.73 
 
 		 1043 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00215799  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  24.95 
 
 		 1019 aa  130  6e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  25.22 
 
 		 1077 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.02 
 
 		 1041 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  25.68 
 
 		 1024 aa  126  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000144327  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  25.68 
 
 		 1024 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000219694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.46 
 
 		 1024 aa  124  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000877394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1024 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000375259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  24.46 
 
 		 1024 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000026518  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3281  beta-D-galactosidase  24.46 
 
 		 1024 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000245928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0417  beta-D-galactosidase  24.73 
 
 		 1024 aa  124  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000241482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.71 
 
 		 1005 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.49 
 
 		 968 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  25.05 
 
 		 1046 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  25.39 
 
 		 1076 aa  121  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.49 
 
 		 1264 aa  120  4.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  24.19 
 
 		 1045 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  23.86 
 
 		 1050 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  24.78 
 
 		 1003 aa  118  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  24.11 
 
 		 1066 aa  117  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  24.77 
 
 		 1035 aa  116  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  24.59 
 
 		 1108 aa  116  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  23.91 
 
 		 1024 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  23.93 
 
 		 1066 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  25.69 
 
 		 1008 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  22.34 
 
 		 1030 aa  114  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  24.9 
 
 		 1023 aa  111  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  22.16 
 
 		 1030 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.16 
 
 		 1030 aa  110  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  22.16 
 
 		 1030 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  22.16 
 
 		 1030 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  22.16 
 
 		 1030 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  21.98 
 
 		 1030 aa  109  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  21.98 
 
 		 1030 aa  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.63 
 
 		 1003 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  24.78 
 
 		 1059 aa  104  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  23.99 
 
 		 1012 aa  104  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  29.29 
 
 		 1032 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.35 
 
 		 1329 aa  100  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03337  beta-D-galactosidase, alpha subunit  28.79 
 
 		 245 aa  99.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.72 
 
 		 1053 aa  97.1  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  20.84 
 
 		 1030 aa  93.2  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.22 
 
 		 1004 aa  92.4  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  23.12 
 
 		 1026 aa  90.1  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  23.8 
 
 		 992 aa  89  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  22.51 
 
 		 1020 aa  88.6  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  27.67 
 
 		 1030 aa  87  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  23.02 
 
 		 1045 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.17 
 
 		 1036 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03201  beta-galactosidase (Eurofung)  31.1 
 
 		 1030 aa  80.5  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.112028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.91 
 
 		 1424 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  31.87 
 
 		 1023 aa  79  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0750  beta-galactosidase  30.43 
 
 		 1009 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0186034  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.86 
 
 		 1600 aa  76.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3187  glycoside hydrolase family protein  30.28 
 
 		 1022 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.68 
 
 		 992 aa  75.1  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0766  beta-galactosidase  30.43 
 
 		 1012 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.156765  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30036  Beta-galactosidase (Lactase)  22.75 
 
 		 1021 aa  73.9  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0855272  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  27.92 
 
 		 1017 aa  71.2  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3257  glycoside hydrolase family protein  20.99 
 
 		 1017 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0289  glycoside hydrolase family 42 protein  25.53 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0613274  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.78 
 
 		 1289 aa  62.8  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26640  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  37.25 
 
 		 996 aa  59.7  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2026  glycoside hydrolase family 42 protein  28.72 
 
 		 326 aa  52  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2025  glycoside hydrolase family protein  43.64 
 
 		 640 aa  47.8  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00409776  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1950  beta-galactosidase  32.11 
 
 		 103 aa  46.6  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0288  glycoside hydrolase family protein  41.82 
 
 		 628 aa  46.2  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000148878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>