63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1950 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1950  beta-galactosidase  100 
 
 		 103 aa  213  9e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  70.19 
 
 		 1023 aa  155  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  54.55 
 
 		 1005 aa  97.1  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  47.19 
 
 		 1012 aa  88.2  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  42.16 
 
 		 1008 aa  86.7  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  42.86 
 
 		 1013 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  43.56 
 
 		 1026 aa  83.6  9e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2026  glycoside hydrolase family 42 protein  40.54 
 
 		 326 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0289  glycoside hydrolase family 42 protein  59.32 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0613274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  37.74 
 
 		 1049 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  37.38 
 
 		 1035 aa  66.2  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  40.23 
 
 		 1084 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  40.23 
 
 		 1084 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  37.5 
 
 		 1019 aa  62  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  37.23 
 
 		 1455 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  38.64 
 
 		 1030 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  37.63 
 
 		 1045 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  39.05 
 
 		 1094 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  41.46 
 
 		 1264 aa  57.4  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 1077 aa  57  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  38.89 
 
 		 1129 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.02 
 
 		 1036 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.18 
 
 		 1033 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  32.41 
 
 		 1059 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  32.61 
 
 		 1043 aa  53.9  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  34 
 
 		 1017 aa  53.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  50 
 
 		 1044 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.25 
 
 		 1329 aa  51.2  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119488  Beta-galactosidase, putative  29.17 
 
 		 1164 aa  51.2  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873023  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  35.63 
 
 		 1063 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  33.7 
 
 		 1079 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  36.36 
 
 		 1035 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03201  beta-galactosidase (Eurofung)  31.07 
 
 		 1030 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.112028 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  31.87 
 
 		 1032 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.41 
 
 		 1003 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  34.78 
 
 		 1046 aa  48.9  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  31.87 
 
 		 1108 aa  47.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46582  predicted protein  32.11 
 
 		 561 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03337  beta-D-galactosidase, alpha subunit  31.87 
 
 		 245 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.72 
 
 		 968 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  30 
 
 		 1076 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  28 
 
 		 1041 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  33.33 
 
 		 1023 aa  44.7  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  34.85 
 
 		 1036 aa  44.7  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  42.37 
 
 		 1066 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  38.64 
 
 		 1043 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  42.37 
 
 		 1066 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  42.37 
 
 		 1050 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  45.76 
 
 		 1029 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  35.42 
 
 		 1004 aa  41.2  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  37.29 
 
 		 1024 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000026518  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  37.29 
 
 		 1024 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000877394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  37.29 
 
 		 1024 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000144327  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  37.29 
 
 		 1024 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000219694  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  37.29 
 
 		 1024 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000375259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3281  beta-D-galactosidase  37.29 
 
 		 1024 aa  41.2  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000245928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0417  beta-D-galactosidase  37.29 
 
 		 1024 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000241482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  38.36 
 
 		 1036 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  34.38 
 
 		 1031 aa  41.2  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  37.29 
 
 		 1024 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  36.11 
 
 		 1018 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  36.11 
 
 		 1003 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30036  Beta-galactosidase (Lactase)  33 
 
 		 1021 aa  40.4  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0855272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>