More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20755 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_20755  predicted protein  100 
 
 		 270 aa  537  9.999999999999999e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44871  predicted protein  41.96 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  37.94 
 
 		 281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4531  Aquaporin  36.84 
 
 		 283 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174053  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4090  MIP family channel protein  39.29 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2278  propanediol diffusion facilitator  37.35 
 
 		 269 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682066  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0160  MIP family channel protein  37.55 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2160  propanediol diffusion facilitator  39.02 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2373  propanediol diffusion facilitator  39.02 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0974119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2260  propanediol diffusion facilitator  39.02 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  0.201769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2214  propanediol diffusion facilitator  39.02 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.839168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2207  propanediol diffusion facilitator  39.02 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.863127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0101  glycerol uptake facilitator protein  37.96 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0102  glycerol uptake facilitator protein  37.96 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4112  MIP family channel protein  37.96 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0175  MIP family channel protein  37.15 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1076  MIP family channel protein  36.12 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1562  glycerol uptake facilitator protein  38.04 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1117  MIP family channel protein  36.12 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4336  MIP family channel protein  36.12 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.277655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0897  MIP family channel protein  37.08 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1105  MIP family channel protein  35.74 
 
 		 283 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17980  glycerol uptake facilitator protein  36.86 
 
 		 279 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0206  MIP family channel protein  37.05 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4167  glycerol uptake facilitator protein  34.92 
 
 		 285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1915  major intrinsic protein  36.48 
 
 		 281 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03312  hypothetical protein  36.07 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002676  glycerol uptake facilitator protein  36.89 
 
 		 284 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3904  major intrinsic protein  34.52 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3802  MIP family channel protein  35.97 
 
 		 281 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0109  MIP family channel protein  36.73 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205749  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45700  glycerol uptake facilitator protein  36.29 
 
 		 279 aa  131  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0384  glycerol uptake facilitator protein  36.4 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.418128  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4409  glycerol uptake facilitator protein  35.1 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0436905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03812  glycerol facilitator  35.1 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4058  MIP family channel protein  35.1 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5382  glycerol uptake facilitator protein  35.1 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03761  hypothetical protein  35.1 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4461  glycerol uptake facilitator protein  35.1 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625465  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4091  MIP family channel protein  35.1 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4367  glycerol uptake facilitator protein  35.1 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4333  glycerol uptake facilitator protein  35.1 
 
 		 281 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00574638  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4416  glycerol uptake facilitator protein  35.1 
 
 		 281 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4158  glycerol uptake facilitator protein  34.69 
 
 		 281 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4418  glycerol uptake facilitator protein  35.1 
 
 		 281 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4486  glycerol uptake facilitator protein  35.1 
 
 		 281 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4303  glycerol uptake facilitator protein  35.1 
 
 		 281 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0683  glycerol uptake facilitator protein  36.78 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.962847  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2332  MIP family channel protein  34.6 
 
 		 295 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01532  glycerol uptake facilitator protein GlpF  36.07 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  36.23 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1388  MIP family channel protein  35.18 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1460  glycerol uptake facilitator protein  34.78 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.316645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3914  MIP family channel protein  35.61 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4046  MIP family channel protein  34.45 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2986  MIP family channel protein  35.91 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.862108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  37.94 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0495  MIP family channel protein  37.94 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  32.09 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2435  MIP family channel protein  37.21 
 
 		 275 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7483  MIP family channel protein  37.4 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5125  MIP family channel protein  35.06 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  31.27 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3532  major intrinsic protein  33.73 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0245  glycerol uptake facilitator  30.9 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  33.2 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1007  MIP family channel protein  34.81 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0697124  decreased coverage  0.00139101 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  31.73 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  32.81 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0409  glycerol uptake facilitator protein  33.73 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03915  MIP aquaporin (Eurofung)  32.6 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.182238 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0253  major intrinsic protein  32.67 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.740215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1215  MIP family channel protein  37.15 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.576711  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1752  major intrinsic protein  30.92 
 
 		 235 aa  88.6  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07618  MIP aquaporin (Eurofung)  30.74 
 
 		 612 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.82255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  31.85 
 
 		 242 aa  86.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02822  MIP aquaporin (Eurofung)  30.26 
 
 		 449 aa  85.5  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.745913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1487  glycerol uptake facilitator  33.07 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00172082  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1986  major intrinsic protein  31.45 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000584519 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  31.23 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2001  aquaporin Z  34 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00830  MIP aquaporin (Eurofung)  30 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23040  MIP family channel protein  33.06 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5300  major intrinsic protein  32.59 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0981  aquaporin Z  31.2 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3008  major intrinsic protein  29.41 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3650  MIP family channel protein  32.68 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0294  MIP family channel protein  31.71 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803178  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2513  MIP family channel protein  31.72 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2846  MIP family channel protein  30.92 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324919  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  32.26 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0379  MIP family channel protein  34.72 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.995202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  30.92 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4188  MIP family channel protein  29.84 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0086  glycerol facilitator-aquaporin  33.96 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385513 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1170  putative glycerol uptake facilitator protein  30.36 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2878  glycerol uptake facilitator protein  29.39 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1001  glycerol uptake facilitator protein  30.36 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.379218  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1925  aquaporin Z  32.54 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1384  MIP family channel protein  32.11 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>