290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11690 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_11690  predicted protein  100 
 
 
251 aa  518  1e-146  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47161  predicted protein  32.03 
 
 
379 aa  89.4  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0374083  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3175  TatD-related deoxyribonuclease  28.96 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0250  TatD-related deoxyribonuclease  29.26 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1824  TatD-related deoxyribonuclease  29.91 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  30.43 
 
 
251 aa  72  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04048  Cut9 interacting protein Scn1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03870)  23.15 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.900915 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  26.87 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  31.69 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0265  hydrolase, TatD family  24.23 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0321314  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1277  TatD-related deoxyribonuclease  26.05 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1109  TatD family hydrolase  27.31 
 
 
300 aa  65.5  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0321  TatD-related deoxyribonuclease  25.34 
 
 
254 aa  63.2  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  28.76 
 
 
263 aa  63.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  29.12 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  27.47 
 
 
261 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  26.19 
 
 
253 aa  62  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1922  hypothetical protein  25.45 
 
 
256 aa  62  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2036  TatD-related deoxyribonuclease  29.02 
 
 
258 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2106  TatD-related deoxyribonuclease  28.12 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  24.14 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  29.12 
 
 
260 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  26.78 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  26.78 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04964  conserved hypothetical protein  28.72 
 
 
334 aa  59.7  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0783  hydrolase, putative  25.34 
 
 
275 aa  59.7  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  26.23 
 
 
260 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2173  Sec-independent protein translocase TatD  23.91 
 
 
261 aa  58.9  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.69531 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0118  TatD family hydrolase  25.99 
 
 
276 aa  58.9  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.373882  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  24.32 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02995  putative deoxyribonuclease  23.11 
 
 
280 aa  58.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537161  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  25.78 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  26.23 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  27.27 
 
 
265 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  29.14 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1991  TatD-related deoxyribonuclease  25.78 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.126048  decreased coverage  0.0000779322 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1316  putative metallodependent hydrolase  27.27 
 
 
265 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  hitchhiker  0.00000000025238 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  24.78 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  25.29 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  25.64 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2167  putative metallodependent hydrolase  27.27 
 
 
265 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  hitchhiker  0.000000000251924 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  27.14 
 
 
260 aa  57  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  29.14 
 
 
261 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  28.26 
 
 
261 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1278  putative metallodependent hydrolase  26.84 
 
 
265 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.558923  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  26.37 
 
 
254 aa  56.6  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0891  Sec-independent protein translocase TatD  28.73 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2775  TatD-related deoxyribonuclease  28.49 
 
 
217 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.115989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  22.61 
 
 
258 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  25.29 
 
 
259 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  26.86 
 
 
287 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  26.11 
 
 
263 aa  55.8  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1083  TatD-related deoxyribonuclease  24.66 
 
 
258 aa  55.8  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  25.65 
 
 
263 aa  55.5  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89332  predicted protein  27.43 
 
 
283 aa  55.5  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.581963 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1984  putative metallodependent hydrolase  26.41 
 
 
265 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000140367  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  28.21 
 
 
265 aa  55.5  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  23.85 
 
 
265 aa  55.5  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  25 
 
 
263 aa  55.1  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  25.95 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  25.78 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  24.71 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  25.5 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  36.64 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  26.23 
 
 
265 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  26.23 
 
 
265 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  28.33 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0740  hydrolase, TatD family  25.33 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0653  TatD-related deoxyribonuclease  25.31 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0953194  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  26.04 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  28.02 
 
 
256 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  26.41 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  26.41 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  26.23 
 
 
265 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  25.82 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  26.41 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  26.04 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  24.62 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  26.67 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  26.23 
 
 
265 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  26.23 
 
 
265 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00230  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 
459 aa  53.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.231233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  26.23 
 
 
265 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  26.23 
 
 
265 aa  53.9  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  27.78 
 
 
457 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  26.34 
 
 
264 aa  53.9  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  26.23 
 
 
265 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  25.5 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  24.19 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  26.07 
 
 
258 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1779  hydrolase, TatD family  25 
 
 
265 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1752  hydrolase, TatD family  25 
 
 
265 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  27.32 
 
 
255 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1018  TatD family hydrolase  26.07 
 
 
261 aa  53.1  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195274  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  25.97 
 
 
259 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  26.41 
 
 
263 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  23.68 
 
 
255 aa  53.1  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  25.5 
 
 
260 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  23.94 
 
 
258 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3661  TatD family hydrolase  30.43 
 
 
269 aa  52.8  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>