133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1395 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1395  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 295 aa  605  9.999999999999999e-173  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0343017 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3831  rod shape-determining protein MreC  31.62 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.277446  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5926  Rod shape-determining protein MreC  29.72 
 
 		 278 aa  149  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1457  rod shape-determining protein MreC  31.27 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  30.9 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0193  rod shape-determining protein MreC  31.99 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  28.62 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3307  rod shape-determining protein MreC  29.72 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.198941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00570  rod shape-determining protein  29 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119359  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0807  rod shape-determining protein MreC  31.36 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  29.62 
 
 		 280 aa  119  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  27.99 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  33.06 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0573  rod shape-determining protein MreC  30.64 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.431817 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0866  rod shape-determining protein MreC  29.14 
 
 		 280 aa  96.7  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0711  rod shape-determining protein MreC  25.09 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1166  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  26.92 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1803  rod shape-determining protein MreC  23.94 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  32.08 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  24.22 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  24.22 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  25.7 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  26.91 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  28.04 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  26.89 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  30.9 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  27.54 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  25.45 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  24.4 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  26.69 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  26.06 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  26.27 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  26.27 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  28.1 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  26.46 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  24.37 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  24.37 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  32.21 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  28.99 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  24.02 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  30.08 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  31.52 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  26.88 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  26.7 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  28.15 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  27.38 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1212  rod shape-determining protein MreC  33.63 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0749  rod shape-determining protein MreC  34.01 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  24.64 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  26.4 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  26.46 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0839  Rod shape-determining protein MreC  26.67 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  25.98 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  27.01 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  27.01 
 
 		 276 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  22.59 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  24.81 
 
 		 285 aa  50.8  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  28.94 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  28.21 
 
 		 251 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  27 
 
 		 448 aa  50.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  25.64 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  27.18 
 
 		 286 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  27.45 
 
 		 296 aa  49.7  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  27.08 
 
 		 274 aa  49.3  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  26.12 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  26.12 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  24.49 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  27.05 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  22.94 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  22.94 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  28.15 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  23.73 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  22.76 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  25.11 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  27.78 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  26.23 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5268  rod shape-determining protein MreC  31.19 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  23.72 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  26.15 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  26.15 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  26.32 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  27.34 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4600  rod shape-determining protein MreC  26.52 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1403  Rod shape-determining protein MreC  27.93 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000400857  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  28.36 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  24.03 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  24.86 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  29.77 
 
 		 249 aa  46.6  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  25.48 
 
 		 272 aa  46.6  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  27.05 
 
 		 283 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  26.15 
 
 		 251 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  27.78 
 
 		 273 aa  45.8  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  24.08 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  24.26 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  24.19 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>