112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4184 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  65.49 
 
 		 586 aa  788    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 581 aa  1187    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  65.66 
 
 		 586 aa  790    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 581 aa  1187    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  46.56 
 
 		 593 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  46.53 
 
 		 591 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  41.15 
 
 		 581 aa  382  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  41.65 
 
 		 551 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  43.39 
 
 		 491 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  38.81 
 
 		 550 aa  362  1e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  39.1 
 
 		 572 aa  346  5e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  36.73 
 
 		 542 aa  332  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  36.3 
 
 		 539 aa  320  6e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  34.46 
 
 		 658 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  41.72 
 
 		 632 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  40.68 
 
 		 645 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  35.52 
 
 		 641 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  35.53 
 
 		 666 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  35.53 
 
 		 666 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  34.78 
 
 		 574 aa  302  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  35.57 
 
 		 533 aa  283  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  35.77 
 
 		 589 aa  282  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  33.98 
 
 		 561 aa  282  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  37.16 
 
 		 531 aa  281  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  34.4 
 
 		 639 aa  278  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  37.09 
 
 		 529 aa  275  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  35.81 
 
 		 530 aa  273  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  34.55 
 
 		 563 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  35.07 
 
 		 622 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  33.75 
 
 		 550 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  34.59 
 
 		 624 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  33.63 
 
 		 548 aa  246  8e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  33.58 
 
 		 571 aa  245  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  31.03 
 
 		 604 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  33.27 
 
 		 531 aa  236  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  33.16 
 
 		 643 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  33.57 
 
 		 543 aa  235  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  34.52 
 
 		 518 aa  233  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  32.05 
 
 		 508 aa  226  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  29.34 
 
 		 600 aa  225  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  32.73 
 
 		 513 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  32.74 
 
 		 510 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  31.71 
 
 		 524 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  30.9 
 
 		 555 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  31.5 
 
 		 543 aa  199  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  31.47 
 
 		 514 aa  197  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  32.02 
 
 		 500 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  31.14 
 
 		 606 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  33.16 
 
 		 561 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  30.76 
 
 		 531 aa  190  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  30.43 
 
 		 578 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  29.86 
 
 		 629 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  31.72 
 
 		 528 aa  176  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  28.96 
 
 		 518 aa  169  9e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  38.87 
 
 		 475 aa  168  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  29.06 
 
 		 544 aa  158  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  41.27 
 
 		 527 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  34.44 
 
 		 568 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  48.55 
 
 		 188 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  64.38 
 
 		 261 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  66.2 
 
 		 262 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  66.2 
 
 		 262 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  29.27 
 
 		 450 aa  87  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  28.19 
 
 		 515 aa  87  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  29.07 
 
 		 515 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  39.05 
 
 		 946 aa  71.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  38.38 
 
 		 485 aa  69.7  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  23.85 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  37.04 
 
 		 932 aa  67  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  38.52 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  25.29 
 
 		 383 aa  66.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  27.94 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  23.6 
 
 		 440 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  26.24 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  23.67 
 
 		 432 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  35.24 
 
 		 919 aa  61.2  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  34.04 
 
 		 255 aa  60.1  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  23.44 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  24.14 
 
 		 437 aa  57  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  30.65 
 
 		 361 aa  57  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  32.48 
 
 		 186 aa  54.3  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  34.17 
 
 		 673 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  37.76 
 
 		 424 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  24.13 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  23.93 
 
 		 784 aa  52.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  24.59 
 
 		 385 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  32.29 
 
 		 1036 aa  51.2  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  32.56 
 
 		 343 aa  51.2  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  30.77 
 
 		 330 aa  50.4  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  26.34 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  43.33 
 
 		 575 aa  49.7  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  24.94 
 
 		 355 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  42.59 
 
 		 1821 aa  47.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  22.64 
 
 		 384 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  22.62 
 
 		 333 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  40.74 
 
 		 400 aa  47  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  28.57 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  40.74 
 
 		 400 aa  47  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  29.75 
 
 		 694 aa  46.6  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  46.94 
 
 		 506 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>