More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3717 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 179 aa  355  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  77.65 
 
 		 179 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  77.65 
 
 		 179 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  67.6 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  69.01 
 
 		 182 aa  237  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  69.27 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  68.42 
 
 		 182 aa  230  8.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  63.69 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  61.24 
 
 		 178 aa  219  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  59.78 
 
 		 179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  60.22 
 
 		 181 aa  216  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  59.55 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1306  50S ribosomal protein L6  59.69 
 
 		 191 aa  215  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  60.34 
 
 		 179 aa  214  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  58.99 
 
 		 179 aa  214  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  59.22 
 
 		 179 aa  213  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  59.22 
 
 		 179 aa  212  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  59.22 
 
 		 179 aa  211  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  59.55 
 
 		 178 aa  210  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  59.55 
 
 		 178 aa  210  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17351  50S ribosomal protein L6  58.1 
 
 		 179 aa  209  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  57.54 
 
 		 179 aa  206  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  57.3 
 
 		 178 aa  206  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  57.54 
 
 		 179 aa  205  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  58.43 
 
 		 178 aa  205  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  54.44 
 
 		 180 aa  204  5e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 178 aa  200  9e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  56.74 
 
 		 177 aa  200  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  57.3 
 
 		 178 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  198  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 179 aa  197  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  54.19 
 
 		 179 aa  197  7e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  54.19 
 
 		 179 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  56.42 
 
 		 182 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  55.56 
 
 		 180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  56.42 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  53.93 
 
 		 178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  53.71 
 
 		 177 aa  194  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 180 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 178 aa  194  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  55.62 
 
 		 181 aa  193  9e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  193  9e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 178 aa  193  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  55.56 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  55.43 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  55.06 
 
 		 178 aa  193  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2050  ribosomal protein L6  56.42 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.0184636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 178 aa  192  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 179 aa  191  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 178 aa  191  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 180 aa  191  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  56.14 
 
 		 183 aa  191  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 178 aa  190  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  57.89 
 
 		 184 aa  190  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27601  Plastid ribosomal protein L6 large ribosomal subunit  51.41 
 
 		 213 aa  189  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.935341  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  57.14 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  54.39 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 180 aa  187  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  53.93 
 
 		 180 aa  187  7e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  187  7e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  187  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2033  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 180 aa  187  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.693671  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  187  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  187  9e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1948  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 180 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  56.42 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  53.71 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0492  ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187085  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  53.71 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>