More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1274 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  95.81 
 
 		 383 aa  769    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 383 aa  800    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  72.25 
 
 		 384 aa  611  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  70.68 
 
 		 380 aa  575  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  51.82 
 
 		 384 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  50.26 
 
 		 385 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  48.03 
 
 		 381 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  47.24 
 
 		 381 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  47.01 
 
 		 384 aa  353  4e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  44.62 
 
 		 382 aa  342  5e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  44.36 
 
 		 382 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  41.16 
 
 		 377 aa  323  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  40.63 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  39.89 
 
 		 386 aa  280  4e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  38.36 
 
 		 374 aa  270  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  38.85 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  40.16 
 
 		 390 aa  261  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  38.52 
 
 		 382 aa  245  9e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  38.95 
 
 		 384 aa  244  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  31.51 
 
 		 394 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  31.02 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.2 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.22 
 
 		 391 aa  170  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  30.33 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  29.92 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  28.93 
 
 		 371 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  29 
 
 		 378 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  29.44 
 
 		 381 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  29.62 
 
 		 381 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  32.05 
 
 		 387 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  30.61 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  29.97 
 
 		 378 aa  160  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  29.11 
 
 		 378 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 380 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  30.15 
 
 		 377 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  29.35 
 
 		 393 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  30.63 
 
 		 396 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 377 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  29 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  30.4 
 
 		 376 aa  157  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  30.1 
 
 		 378 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  30.52 
 
 		 387 aa  155  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  31.15 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  31.57 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  27.61 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  28.36 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  27.91 
 
 		 381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  29.1 
 
 		 381 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  30.91 
 
 		 379 aa  152  8.999999999999999e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  28.72 
 
 		 376 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  29.33 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  29.72 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  31.35 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  31.5 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  29.35 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  28.33 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  29.2 
 
 		 371 aa  149  9e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.34 
 
 		 390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 		 387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  28.61 
 
 		 376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  30.92 
 
 		 393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  28.64 
 
 		 396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 		 384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.49 
 
 		 346 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  28.39 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  28.91 
 
 		 390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  28.94 
 
 		 371 aa  146  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  29.44 
 
 		 376 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  30.47 
 
 		 394 aa  142  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.57 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  28.57 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  28.82 
 
 		 419 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  27.11 
 
 		 389 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 		 387 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  29.68 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 		 387 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  27.05 
 
 		 382 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  28.18 
 
 		 378 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  31.64 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  29.04 
 
 		 371 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  30.13 
 
 		 364 aa  136  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  27.54 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  34.35 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  30 
 
 		 395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 393 aa  133  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  29.95 
 
 		 369 aa  132  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  26.93 
 
 		 373 aa  132  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  31.61 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  27.75 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  31.36 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  31.36 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>