161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_29321 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_29321  permease  100 
 
 
318 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  83.33 
 
 
323 aa  418  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  81.45 
 
 
318 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  40 
 
 
335 aa  214  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  36.75 
 
 
350 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  40 
 
 
341 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  41.09 
 
 
336 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  37.6 
 
 
362 aa  200  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  37.65 
 
 
343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  37.65 
 
 
343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  36.09 
 
 
350 aa  194  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  32.74 
 
 
300 aa  154  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  32.03 
 
 
300 aa  149  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  28.47 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  35.39 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  28.47 
 
 
297 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  35.13 
 
 
358 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  33.92 
 
 
346 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  31.87 
 
 
298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  31.87 
 
 
298 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  31.87 
 
 
298 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  31.87 
 
 
298 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  31.87 
 
 
298 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  31.14 
 
 
298 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  31.87 
 
 
298 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  31.87 
 
 
298 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  31.87 
 
 
298 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  31.87 
 
 
298 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  30.4 
 
 
325 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  28.94 
 
 
371 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  30.41 
 
 
298 aa  139  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  34.43 
 
 
288 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  29.67 
 
 
325 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  30.4 
 
 
324 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  33.66 
 
 
328 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  30.4 
 
 
324 aa  135  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  29.67 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  29.67 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  33.33 
 
 
328 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  31.5 
 
 
288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  31.54 
 
 
524 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  26.88 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  31.13 
 
 
370 aa  126  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  35.34 
 
 
334 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  32.79 
 
 
343 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  25.62 
 
 
524 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  30.16 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  31.41 
 
 
332 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  33.45 
 
 
352 aa  106  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  29.3 
 
 
364 aa  105  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  34.6 
 
 
350 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  35.6 
 
 
357 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  31.97 
 
 
368 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  44.76 
 
 
365 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  25.24 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  27.72 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  25.49 
 
 
356 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  25 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  28.62 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  28.1 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  29.28 
 
 
620 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  28.15 
 
 
365 aa  65.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  23.75 
 
 
367 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  25.88 
 
 
391 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  25.54 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  32.34 
 
 
451 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  24.92 
 
 
363 aa  62  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  26.07 
 
 
324 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  28.07 
 
 
318 aa  60.5  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  22.81 
 
 
337 aa  59.7  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  24.04 
 
 
311 aa  59.3  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4074  putative permease  27.24 
 
 
366 aa  59.3  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  32.14 
 
 
475 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  27.01 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  21.98 
 
 
331 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  25.15 
 
 
323 aa  56.6  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  20.63 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  38.1 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  21.82 
 
 
367 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  38.6 
 
 
296 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  20.85 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  24.74 
 
 
333 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  32.77 
 
 
378 aa  54.3  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  29.54 
 
 
350 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  21.99 
 
 
337 aa  53.9  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  23.58 
 
 
315 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  24.54 
 
 
341 aa  53.1  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  25.09 
 
 
350 aa  53.1  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  20.87 
 
 
319 aa  52.8  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  25.73 
 
 
333 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  38.64 
 
 
423 aa  52.8  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  23.58 
 
 
300 aa  52.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  29.58 
 
 
490 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  38.37 
 
 
461 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  22.86 
 
 
344 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  24.42 
 
 
338 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  36.47 
 
 
474 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  20.74 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0563  permease  24.6 
 
 
633 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  25 
 
 
350 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>