More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_03911 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_03911  TIM-barrel fold family protein  100 
 
 		 213 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21481  TIM-barrel fold family protein  63.59 
 
 		 225 aa  251  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04461  TIM-barrel fold family protein  59.69 
 
 		 213 aa  241  7e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1729  hypothetical protein  59.69 
 
 		 213 aa  240  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0647  hypothetical protein  59.9 
 
 		 199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.824567  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  59.07 
 
 		 220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04561  TIM-barrel fold family protein  55.1 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.618562  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0390  hypothetical protein  50.24 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.250945  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04141  TIM-barrel fold family protein  53.09 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04451  TIM-barrel fold family protein  51.85 
 
 		 190 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.344267  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  46.27 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  43.07 
 
 		 222 aa  164  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  44.04 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  44.29 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  44.04 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  43.35 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  43.84 
 
 		 226 aa  157  8e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  43.2 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  45.19 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  45.19 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  43.33 
 
 		 230 aa  153  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1232  alanine racemase domain protein  41.26 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  42.38 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  45.73 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  42.86 
 
 		 234 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  41.15 
 
 		 237 aa  151  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  45.12 
 
 		 230 aa  151  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  39.32 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  42.52 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  38.39 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  43.37 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  40.39 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  40.1 
 
 		 231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  40.57 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  40.67 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  40.48 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  36.07 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  37.91 
 
 		 231 aa  141  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  39.5 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  40.85 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  37.44 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  39.81 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  40.67 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  42.29 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  41.12 
 
 		 235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  39.34 
 
 		 229 aa  138  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  39.52 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  39.6 
 
 		 231 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  39.81 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  37.38 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  40.65 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  38.76 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  41.84 
 
 		 228 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2507  alanine racemase domain protein  40.67 
 
 		 238 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  35.81 
 
 		 231 aa  135  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  38.86 
 
 		 214 aa  134  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  39.9 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  40.48 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  35.84 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  43.5 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  36.79 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  36.15 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  38.97 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  40.89 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  37.62 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  38.69 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  39.8 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  39.8 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  36.45 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  38.1 
 
 		 229 aa  131  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  38.81 
 
 		 224 aa  131  6e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  39.39 
 
 		 231 aa  131  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  40.39 
 
 		 229 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  36.23 
 
 		 229 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  36.28 
 
 		 241 aa  131  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0621  hypothetical protein  40.3 
 
 		 268 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  37.44 
 
 		 237 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  37.26 
 
 		 221 aa  131  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  36.92 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  38.31 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  39 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  38.31 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  36.24 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  38.5 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0647  alanine racemase domain-containing protein  39.8 
 
 		 232 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  39.71 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  38.96 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  37.79 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  34.26 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  35.71 
 
 		 235 aa  128  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3450  alanine racemase domain protein  37.93 
 
 		 237 aa  128  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  38 
 
 		 244 aa  128  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  36.82 
 
 		 231 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0545  alanine racemase domain-containing protein  35.5 
 
 		 242 aa  128  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  40 
 
 		 220 aa  127  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  37.79 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  37.62 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>