More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4002 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  100 
 
 
276 aa  551  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  37.41 
 
 
254 aa  139  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  34.28 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  38.81 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  33.45 
 
 
251 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  37.98 
 
 
244 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 
249 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 
249 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  33.7 
 
 
261 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  37.62 
 
 
248 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  37.62 
 
 
248 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  37.14 
 
 
248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  37.32 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  30.55 
 
 
244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  35.69 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  31.25 
 
 
292 aa  109  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  31.03 
 
 
311 aa  105  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
289 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  33.21 
 
 
237 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  36.81 
 
 
233 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  31.16 
 
 
240 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  37.28 
 
 
242 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  31.35 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 
288 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 
196 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3413  Methyltransferase type 12  27.92 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0292  MCP methyltransferase, CheR-type  28.27 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  33.12 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  36.97 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  43.52 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  22.91 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  35.37 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  42 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  31.37 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  37.61 
 
 
261 aa  72  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  33.74 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  28.91 
 
 
237 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  32.93 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  30.05 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
527 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
531 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  38 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  39.47 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  41.41 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 
527 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.19 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.32 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  35.92 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
519 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4115  methyltransferase type 12  30.6 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.61 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  43 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  31.21 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  33.8 
 
 
349 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.84 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  33.8 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  33.8 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  45.54 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  37.37 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.31 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.77 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  41.84 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  36.43 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  33.57 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12280  predicted protein  40.95 
 
 
285 aa  67  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0372336  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  38.68 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  40.74 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  35.65 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.56 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  41.96 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  40 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  37.37 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  37.37 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  40 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4394  methyltransferase type 11  41.24 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  43.12 
 
 
711 aa  65.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
330 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  39.22 
 
 
229 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  42.2 
 
 
710 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  46.08 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
706 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 
624 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.93 
 
 
213 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  33.99 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0574  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 
291 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  33.99 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  34.69 
 
 
243 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  33.99 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  34.17 
 
 
279 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1569  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>