More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2633 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  80.18 
 
 
444 aa  752    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
444 aa  915    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  79.73 
 
 
444 aa  747    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  46.52 
 
 
480 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  44.84 
 
 
449 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  45.52 
 
 
449 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  44.39 
 
 
449 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  46.1 
 
 
454 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  45.09 
 
 
450 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  44.52 
 
 
450 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  45.29 
 
 
449 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.57 
 
 
467 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  43.82 
 
 
469 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  46.1 
 
 
450 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.77 
 
 
456 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  41.83 
 
 
450 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  41.61 
 
 
450 aa  363  3e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  42.59 
 
 
451 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.76 
 
 
451 aa  356  5e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2643  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  41.59 
 
 
441 aa  344  2e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.65 
 
 
490 aa  343  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  41.45 
 
 
452 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  41.92 
 
 
452 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  43.02 
 
 
448 aa  332  6e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  41.11 
 
 
450 aa  332  6e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  41.69 
 
 
452 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.47 
 
 
444 aa  325  9e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4823  coproporphyrinogen III oxidase  37.44 
 
 
456 aa  325  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 
470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 
451 aa  321  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.5 
 
 
458 aa  317  3e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4236  coproporphyrinogen III oxidase  39.77 
 
 
485 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139524  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  39.54 
 
 
457 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  39.54 
 
 
457 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  39.54 
 
 
457 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  39.58 
 
 
457 aa  315  7e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  40.84 
 
 
489 aa  315  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  39.54 
 
 
457 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.79 
 
 
454 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  40.14 
 
 
494 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0472  coproporphyrinogen III oxidase  37.94 
 
 
455 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.953637  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.74 
 
 
462 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  39.42 
 
 
468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2402  coproporphyrinogen III oxidase  39.16 
 
 
480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  39.68 
 
 
494 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  40.31 
 
 
461 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3100  coproporphyrinogen III oxidase  39.01 
 
 
469 aa  311  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0207  coproporphyrinogen III oxidase  37.32 
 
 
455 aa  310  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119827  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4161  coproporphyrinogen III oxidase  38.85 
 
 
457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0332782  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  38.82 
 
 
451 aa  310  4e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  41.86 
 
 
453 aa  309  5e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  39.08 
 
 
457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.08 
 
 
457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  39.08 
 
 
457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  39.08 
 
 
457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  39.08 
 
 
457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  39.08 
 
 
457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  39.08 
 
 
457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  39.08 
 
 
457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  38.03 
 
 
463 aa  309  8e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  38.62 
 
 
457 aa  309  8e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01054  coproporphyrinogen III oxidase  38.53 
 
 
458 aa  309  8e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.299097  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.91 
 
 
470 aa  309  8e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  35.67 
 
 
451 aa  307  3e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  36.07 
 
 
453 aa  307  3e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  38.03 
 
 
463 aa  306  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2569  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 
449 aa  306  6e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  37.74 
 
 
450 aa  306  7e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4192  coproporphyrinogen III oxidase  37.93 
 
 
457 aa  305  8.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.799407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0024  coproporphyrinogen III oxidase  37.93 
 
 
457 aa  305  8.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0201476  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  38.96 
 
 
465 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0026  coproporphyrinogen III oxidase  37.93 
 
 
457 aa  305  8.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0394693  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  39.02 
 
 
510 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  35.62 
 
 
455 aa  305  9.000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  38.93 
 
 
476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4730  coproporphyrinogen III oxidase  37.47 
 
 
458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0047  coproporphyrinogen III oxidase  36.55 
 
 
446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577126  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4351  coproporphyrinogen III oxidase  36.55 
 
 
446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.42 
 
 
462 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4493  coproporphyrinogen III oxidase  36.55 
 
 
446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.320649 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3368  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.26 
 
 
457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852365  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3913  coproporphyrinogen III oxidase  36.78 
 
 
446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  38.48 
 
 
487 aa  304  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4296  coproporphyrinogen III oxidase  36.55 
 
 
446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000258009 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  38.62 
 
 
457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  40.18 
 
 
461 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3964  coproporphyrinogen III oxidase  37.76 
 
 
457 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0669093  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3720  coproporphyrinogen III oxidase  37.99 
 
 
446 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.959602  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3626  coproporphyrinogen III oxidase  37.01 
 
 
446 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  38.79 
 
 
460 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  38.79 
 
 
460 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  37.87 
 
 
456 aa  302  7.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1104  coproporphyrinogen III oxidase  36.79 
 
 
455 aa  302  9e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0042  coproporphyrinogen III oxidase  35.63 
 
 
446 aa  302  9e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1429  coproporphyrinogen III oxidase  39.26 
 
 
469 aa  301  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0687  coproporphyrinogen III oxidase  37.84 
 
 
452 aa  301  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3911  coproporphyrinogen III oxidase  37.01 
 
 
446 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0495726 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4116  coproporphyrinogen III oxidase  37.01 
 
 
446 aa  301  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  39.12 
 
 
462 aa  301  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.6 
 
 
478 aa  301  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>