103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_24530 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_24530  predicted protein  100 
 
 
218 aa  434  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00133033  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  47.44 
 
 
481 aa  77.4  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  43.75 
 
 
559 aa  70.9  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01940  conserved hypothetical protein  40.24 
 
 
480 aa  68.6  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21039  predicted protein  42.53 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41450  predicted protein  38.04 
 
 
291 aa  64.7  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  37.18 
 
 
253 aa  60.1  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06676  transformer-SR ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05260)  32.71 
 
 
307 aa  55.8  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  33.73 
 
 
319 aa  55.5  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  33.73 
 
 
90 aa  54.7  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  36.78 
 
 
477 aa  53.9  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02989  glycine-rich RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08580)  34.15 
 
 
128 aa  50.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108473  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
90 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34381  predicted protein  32.14 
 
 
319 aa  50.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693095  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  31.71 
 
 
90 aa  50.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  33.73 
 
 
103 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84754  predicted protein  42.86 
 
 
246 aa  50.1  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.345333 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  31.71 
 
 
90 aa  50.1  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  48.98 
 
 
125 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 
88 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  33.33 
 
 
182 aa  48.9  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  32.93 
 
 
90 aa  48.9  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  34.48 
 
 
82 aa  48.5  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  43.75 
 
 
373 aa  48.5  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
95 aa  48.1  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  29.41 
 
 
441 aa  47.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  32.1 
 
 
434 aa  48.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32340  predicted protein  36.84 
 
 
314 aa  47.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.46857  normal  0.27086 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80765  predicted protein  31.51 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02310  conserved hypothetical protein  44.9 
 
 
444 aa  47.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.935562  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  32.53 
 
 
89 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  33.33 
 
 
161 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  27.97 
 
 
605 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  29.67 
 
 
97 aa  46.6  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04890  cytoplasm protein, putative  33.82 
 
 
706 aa  46.6  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  32.26 
 
 
149 aa  46.2  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  31.71 
 
 
88 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  34.07 
 
 
157 aa  45.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  30.2 
 
 
673 aa  45.8  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  30.49 
 
 
90 aa  45.8  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03953  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08040)  29.11 
 
 
353 aa  45.4  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.748027  normal  0.180065 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43211  predicted protein  63.33 
 
 
826 aa  45.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01220  cyclophilin, putative  29.58 
 
 
135 aa  45.4  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  31.88 
 
 
687 aa  45.1  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06501  splicing factor 3b subunit 4 (AFU_orthologue; AFUA_6G05180)  34.15 
 
 
352 aa  45.1  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3413  hypothetical protein  39.13 
 
 
83 aa  45.1  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.212369  normal  0.0411196 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0637  RNP-1 like RNA-binding protein  28.28 
 
 
160 aa  45.1  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  31.71 
 
 
85 aa  45.1  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  39.29 
 
 
160 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03760  hypothetical protein  25.51 
 
 
1121 aa  44.7  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  30 
 
 
143 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  31.18 
 
 
132 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  31.08 
 
 
572 aa  44.3  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  34.18 
 
 
107 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4342  RNP-1 like RNA-binding protein  31.71 
 
 
92 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621123  hitchhiker  0.00155097 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09090  Putative RNA binding proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARJ0]  28.42 
 
 
393 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461764  normal  0.414423 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  28.05 
 
 
173 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  31.18 
 
 
148 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  31.18 
 
 
150 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  34.69 
 
 
291 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  42.55 
 
 
122 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  34.18 
 
 
112 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  34.41 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1013  RNP-1 like RNA-binding protein  24.62 
 
 
164 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000334324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  28.05 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4552  RNP-1 like RNA-binding protein  26.6 
 
 
165 aa  43.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04610  conserved hypothetical protein  34.85 
 
 
304 aa  43.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
90 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  33.72 
 
 
175 aa  43.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  30.59 
 
 
162 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  35.71 
 
 
453 aa  43.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  32.35 
 
 
499 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8270  predicted protein  24.69 
 
 
84 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  32.26 
 
 
181 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  32.53 
 
 
104 aa  43.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  32.79 
 
 
724 aa  42.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  29.7 
 
 
119 aa  42.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1930  RNA-binding region RNP-1  27.38 
 
 
89 aa  42.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  30.23 
 
 
89 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  31.18 
 
 
152 aa  43.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90702  RNA recognition motif-containing protein  37.7 
 
 
694 aa  42.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3300  RNA-binding region RNP-1  24.1 
 
 
166 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.181276  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  31.65 
 
 
114 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  32.56 
 
 
121 aa  42.4  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
101 aa  42.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  30 
 
 
732 aa  42.4  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  28.44 
 
 
101 aa  42  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  37.29 
 
 
91 aa  42.4  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  29.76 
 
 
88 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  34.15 
 
 
86 aa  42.4  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  32.56 
 
 
176 aa  42  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  29.41 
 
 
114 aa  42  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0166  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 
151 aa  42  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000221523  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  32.14 
 
 
88 aa  42  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  28.74 
 
 
107 aa  42  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  29.03 
 
 
134 aa  42  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  24.14 
 
 
96 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  30.38 
 
 
838 aa  41.6  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
115 aa  41.6  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  33.72 
 
 
151 aa  41.6  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>