159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1735 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  100 
 
 		 479 aa  935    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  36.45 
 
 		 483 aa  290  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.48 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  27.13 
 
 		 508 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 		 507 aa  139  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  24.11 
 
 		 483 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 		 514 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  26.84 
 
 		 487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  24.25 
 
 		 484 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 520 aa  126  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 487 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  24.61 
 
 		 497 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  27.86 
 
 		 493 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 		 483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  22.99 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  25.4 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  21.93 
 
 		 501 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 		 509 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  22.67 
 
 		 501 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  22.4 
 
 		 502 aa  109  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  26.48 
 
 		 512 aa  109  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  22.02 
 
 		 486 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  21.21 
 
 		 491 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  23.27 
 
 		 475 aa  106  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  23.27 
 
 		 474 aa  107  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  21.28 
 
 		 487 aa  106  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 490 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  23.5 
 
 		 503 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  23.5 
 
 		 510 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  23.5 
 
 		 510 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  23.84 
 
 		 510 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  22.13 
 
 		 501 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  23.84 
 
 		 510 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  24.42 
 
 		 497 aa  101  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 477 aa  100  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  23.42 
 
 		 488 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 480 aa  98.2  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0892  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 484 aa  97.4  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 479 aa  97.4  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  23.52 
 
 		 492 aa  96.3  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 		 507 aa  95.1  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 503 aa  94.4  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  22.45 
 
 		 492 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 		 471 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  22.45 
 
 		 492 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  22.45 
 
 		 492 aa  94  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  22.69 
 
 		 492 aa  94  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  22.22 
 
 		 492 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 492 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  22.22 
 
 		 492 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  25.57 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 		 475 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 		 482 aa  92.8  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  22.45 
 
 		 492 aa  92.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  20.12 
 
 		 502 aa  91.3  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  22.41 
 
 		 503 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 		 484 aa  90.9  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  22.09 
 
 		 499 aa  89.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3544  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 		 530 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  23.43 
 
 		 492 aa  89  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  22.19 
 
 		 505 aa  87  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  21.07 
 
 		 503 aa  87  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 		 514 aa  86.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  21.59 
 
 		 482 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 		 493 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  20.49 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  21.86 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  21.84 
 
 		 490 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  21.49 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 		 575 aa  81.3  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  22.03 
 
 		 502 aa  80.9  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  23.92 
 
 		 494 aa  80.9  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  22.51 
 
 		 504 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 		 504 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  21.63 
 
 		 467 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  25.59 
 
 		 490 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  20.78 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  21.88 
 
 		 508 aa  76.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  22.5 
 
 		 504 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  22.85 
 
 		 509 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2893  polysaccharide biosynthesis protein  21.62 
 
 		 500 aa  74.7  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2347  polysaccharide biosynthesis protein  22.67 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4807  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 500 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  21.05 
 
 		 506 aa  73.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  19.48 
 
 		 508 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  21.52 
 
 		 500 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  21.61 
 
 		 533 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  21.98 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 		 487 aa  69.7  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0382  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 		 467 aa  68.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.399639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0143  polysaccharide biosynthesis protein  20.99 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  21.66 
 
 		 504 aa  66.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>