21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4807 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4807  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
476 aa  934    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  24.5 
 
 
498 aa  77.8  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  21.84 
 
 
479 aa  75.9  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  26.18 
 
 
508 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 
503 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 
475 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 
484 aa  60.5  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
488 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  21.38 
 
 
487 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
472 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  22.51 
 
 
483 aa  52.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 
497 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  24.55 
 
 
510 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 
510 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  27.11 
 
 
493 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  20.55 
 
 
483 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  28 
 
 
490 aa  47  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  24.7 
 
 
497 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 
486 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  21.94 
 
 
484 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  41.56 
 
 
509 aa  44.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>