177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1774 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
369 aa  761    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 
360 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  25.15 
 
 
408 aa  84  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  26.21 
 
 
348 aa  82.8  0.000000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  26.97 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 
402 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  25.23 
 
 
384 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  24.43 
 
 
396 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  24.63 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  27.11 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  27.91 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  25.74 
 
 
458 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.94 
 
 
390 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  26.91 
 
 
453 aa  70.9  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  27.11 
 
 
459 aa  71.2  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 
453 aa  70.9  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  26.4 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  25.62 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.51 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  21.61 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  23.85 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  27.33 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  28.77 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  24.43 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  25.84 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  25.7 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  22.32 
 
 
391 aa  67  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  24.21 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  26.97 
 
 
452 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  24.04 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  24.15 
 
 
402 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1523  geranylgeranyl reductase  26.11 
 
 
495 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545892  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  23.58 
 
 
377 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  38.39 
 
 
453 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  22.07 
 
 
387 aa  63.5  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  25.99 
 
 
380 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 
399 aa  62.8  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  23.19 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  35.78 
 
 
393 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  24.74 
 
 
398 aa  62.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1245  FAD dependent oxidoreductase  21.94 
 
 
350 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  30.12 
 
 
394 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  22.63 
 
 
353 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  22.63 
 
 
353 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  0.000000000712182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  23.7 
 
 
376 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  25.41 
 
 
406 aa  60.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  25.19 
 
 
405 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 
380 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  25.19 
 
 
405 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.07 
 
 
446 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  24.74 
 
 
455 aa  59.7  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  25.97 
 
 
389 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2954  geranylgeranyl reductase  37.63 
 
 
457 aa  59.3  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  25 
 
 
418 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.48 
 
 
446 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  25.67 
 
 
365 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2558  FAD dependent oxidoreductase  22.85 
 
 
452 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.958993  normal  0.172468 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  26.06 
 
 
380 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  25.13 
 
 
405 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  24.77 
 
 
397 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  25.36 
 
 
396 aa  57.4  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.46 
 
 
468 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  33.62 
 
 
398 aa  57.4  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  36.28 
 
 
394 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  23.81 
 
 
406 aa  57  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  36.28 
 
 
394 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 
406 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 
382 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  23.36 
 
 
452 aa  56.2  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  29.46 
 
 
421 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  22.54 
 
 
377 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  30.67 
 
 
386 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  21.93 
 
 
429 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  23.85 
 
 
457 aa  55.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.99 
 
 
446 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  31.53 
 
 
406 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  23.91 
 
 
379 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  26.47 
 
 
380 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  24.46 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  22.44 
 
 
480 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  21.39 
 
 
429 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  21.39 
 
 
429 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  21.29 
 
 
382 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  36.11 
 
 
394 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  22.34 
 
 
397 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  24.2 
 
 
470 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  21.39 
 
 
429 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  21.41 
 
 
393 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  32.76 
 
 
400 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0218  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  22.47 
 
 
366 aa  53.9  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  23.65 
 
 
407 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3127  geranylgeranyl reductase  25.36 
 
 
458 aa  53.9  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.541663  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  23.82 
 
 
362 aa  53.9  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.73 
 
 
449 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  23.26 
 
 
399 aa  53.5  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  32.7 
 
 
391 aa  53.9  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  22.49 
 
 
444 aa  53.5  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  22.77 
 
 
370 aa  53.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>