More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2616 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2221  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  68.77 
 
 		 562 aa  704    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.202713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2082  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  68.29 
 
 		 562 aa  697    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126939  normal  0.0929922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 568 aa  1116    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3583  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  59.47 
 
 		 583 aa  677    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1185  AMP-dependent synthetase and ligase  57.62 
 
 		 569 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.609931 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17930  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  56.28 
 
 		 574 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.849454 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1327  AMP-dependent synthetase and ligase  53.65 
 
 		 571 aa  557  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1973  AMP-dependent synthetase and ligase  54.4 
 
 		 553 aa  523  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  46.22 
 
 		 584 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.78 
 
 		 561 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.78 
 
 		 561 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.96 
 
 		 563 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.78 
 
 		 563 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.96 
 
 		 563 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.96 
 
 		 582 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.96 
 
 		 582 aa  430  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.96 
 
 		 563 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.61 
 
 		 561 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.61 
 
 		 561 aa  427  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  41.74 
 
 		 566 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  45.36 
 
 		 565 aa  420  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.15 
 
 		 561 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  38.41 
 
 		 569 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  41.16 
 
 		 559 aa  413  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  46.28 
 
 		 551 aa  415  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  39.36 
 
 		 557 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  40.33 
 
 		 583 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  43.32 
 
 		 558 aa  403  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  41.43 
 
 		 561 aa  403  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  40.14 
 
 		 584 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 551 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  37.37 
 
 		 591 aa  397  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  37.2 
 
 		 590 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  40.18 
 
 		 539 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  42.36 
 
 		 549 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  38.43 
 
 		 577 aa  392  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0889  AMP-dependent synthetase and ligase  41.71 
 
 		 560 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0278278 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.74 
 
 		 585 aa  389  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2791  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 		 575 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.444002 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  39.57 
 
 		 564 aa  385  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  39.4 
 
 		 573 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  38.93 
 
 		 578 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4056  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.17 
 
 		 565 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.99 
 
 		 565 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.835945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  38.39 
 
 		 583 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  38.01 
 
 		 554 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3844  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.2 
 
 		 565 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.99 
 
 		 565 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0671762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3653  AMP-dependent synthetase and ligase  40.45 
 
 		 578 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  38.07 
 
 		 559 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3946  AMP-dependent synthetase and ligase  40.45 
 
 		 578 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0770506  normal  0.73273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4353  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.26 
 
 		 565 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4543  AMP-dependent synthetase and ligase  37.21 
 
 		 562 aa  362  7.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.2 
 
 		 562 aa  362  8e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00382962  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.73 
 
 		 562 aa  362  9e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0156421  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1323  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.01 
 
 		 561 aa  362  9e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4097  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.46 
 
 		 563 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21370  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.73 
 
 		 562 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  37.72 
 
 		 559 aa  359  8e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3834  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.12 
 
 		 563 aa  359  9e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  38.9 
 
 		 584 aa  359  9e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.877669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  40.39 
 
 		 584 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  37.72 
 
 		 559 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2760  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.67 
 
 		 573 aa  358  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000411499  hitchhiker  0.00194378 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4074  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.19 
 
 		 561 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3939  AMP-dependent synthetase and ligase  39.76 
 
 		 585 aa  355  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0606256 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1416  AMP-dependent synthetase and ligase  38.73 
 
 		 584 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498039  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4674  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 		 584 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0112629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2739  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.17 
 
 		 569 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3797  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 		 566 aa  353  5e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3752  AMP-dependent synthetase and ligase  37.14 
 
 		 557 aa  352  8e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419437  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3104  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37 
 
 		 569 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1344  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.12 
 
 		 572 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.1 
 
 		 557 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.92 
 
 		 557 aa  350  3e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0946  AMP-dependent synthetase and ligase  38.39 
 
 		 559 aa  350  4e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5859  AMP-dependent synthetase and ligase  36.62 
 
 		 567 aa  350  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2857  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.57 
 
 		 569 aa  350  5e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3734  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.86 
 
 		 560 aa  350  5e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.862355  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4746  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.03 
 
 		 563 aa  349  7e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  36.44 
 
 		 558 aa  349  7e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1625  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.51 
 
 		 557 aa  349  8e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000265085  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  35.97 
 
 		 564 aa  349  9e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2523  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.32 
 
 		 557 aa  348  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313327  normal  0.944689 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.98 
 
 		 561 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  36.96 
 
 		 561 aa  348  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  37.46 
 
 		 543 aa  348  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.98 
 
 		 561 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 		 553 aa  348  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1054  AMP-dependent synthetase and ligase  38.77 
 
 		 584 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63665  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0353  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  37.19 
 
 		 565 aa  347  2e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.333466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  37.3 
 
 		 560 aa  348  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.98 
 
 		 561 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.98 
 
 		 561 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.98 
 
 		 561 aa  348  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1534  AMP-dependent synthetase and ligase  38.77 
 
 		 584 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1511  hypothetical protein  35.41 
 
 		 569 aa  347  3e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1510  AMP-dependent synthetase and ligase  38.77 
 
 		 584 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79948  hitchhiker  0.00072846 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.98 
 
 		 561 aa  347  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1256  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 		 573 aa  347  3e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.590511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>