More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1327 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1327  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
571 aa  1162    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17930  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  64.44 
 
 
574 aa  739    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.849454 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1185  AMP-dependent synthetase and ligase  58.78 
 
 
569 aa  616  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.609931 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1973  AMP-dependent synthetase and ligase  55.4 
 
 
553 aa  591  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935913  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.65 
 
 
568 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2082  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.04 
 
 
562 aa  571  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126939  normal  0.0929922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2221  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.72 
 
 
562 aa  561  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.202713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3583  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.52 
 
 
583 aa  557  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  44.19 
 
 
584 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.89 
 
 
561 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.46 
 
 
561 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.3 
 
 
582 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.24 
 
 
561 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.53 
 
 
561 aa  395  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.08 
 
 
563 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.9 
 
 
563 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.08 
 
 
563 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.08 
 
 
563 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.08 
 
 
582 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 
557 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  38.99 
 
 
566 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  37.03 
 
 
551 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  39.44 
 
 
559 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.91 
 
 
561 aa  382  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  39.4 
 
 
561 aa  377  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 
591 aa  378  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  37.59 
 
 
584 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 
569 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  38.93 
 
 
565 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  36.41 
 
 
590 aa  371  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  36.18 
 
 
577 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  39.29 
 
 
549 aa  365  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  36.32 
 
 
583 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.64 
 
 
585 aa  355  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 
564 aa  355  1e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 
564 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2192  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 
588 aa  353  5e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.899371  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  36.28 
 
 
583 aa  352  1e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 
551 aa  352  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 
573 aa  349  8e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  36.76 
 
 
539 aa  347  5e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2760  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.2 
 
 
573 aa  345  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000411499  hitchhiker  0.00194378 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1472  hypothetical protein  35.71 
 
 
569 aa  343  5.999999999999999e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  35.09 
 
 
561 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 
583 aa  342  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.09 
 
 
561 aa  342  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.09 
 
 
561 aa  342  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.09 
 
 
561 aa  342  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.09 
 
 
583 aa  342  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  35.09 
 
 
561 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.26 
 
 
561 aa  341  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1511  hypothetical protein  35.54 
 
 
569 aa  341  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.09 
 
 
561 aa  341  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 
599 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180137  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  35.25 
 
 
554 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2409  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 
554 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0704611  hitchhiker  0.000109312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 
578 aa  340  5e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.61 
 
 
561 aa  339  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.61 
 
 
561 aa  339  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.61 
 
 
561 aa  339  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.61 
 
 
561 aa  339  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.61 
 
 
561 aa  339  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0946  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 
559 aa  339  9e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3249  AMP-dependent synthetase and ligase  34.04 
 
 
572 aa  339  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0843615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 
561 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 
585 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2778  putative long chain fatty-acid CoA ligase(long- chain acyl-CoA synthetase)  36.52 
 
 
604 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422591  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 
569 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 
601 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.455088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5833  AMP-dependent synthetase and ligase  36.75 
 
 
569 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0373  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.5 
 
 
581 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.826783  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 
584 aa  333  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.877669  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2791  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 
575 aa  333  7.000000000000001e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.444002 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3104  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.7 
 
 
569 aa  332  9e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219632  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1416  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 
584 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498039  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0289  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.41 
 
 
554 aa  332  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883702  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.23 
 
 
557 aa  332  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000148173  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 
558 aa  332  1e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336851  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2994  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.46 
 
 
560 aa  332  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1510  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 
584 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79948  hitchhiker  0.00072846 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4674  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 
584 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0112629 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1054  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 
584 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63665  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3792  AMP-dependent synthetase and ligase  36.95 
 
 
571 aa  332  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1534  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 
584 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 
584 aa  331  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2155  AMP-dependent synthetase and ligase  33.75 
 
 
594 aa  331  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657551  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0303  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.71 
 
 
581 aa  331  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 
559 aa  330  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 
559 aa  330  4e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 
561 aa  330  5.0000000000000004e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.63 
 
 
572 aa  330  5.0000000000000004e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1625  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.21 
 
 
557 aa  330  6e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000265085  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.33 
 
 
560 aa  330  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2523  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.06 
 
 
557 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313327  normal  0.944689 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  36.81 
 
 
558 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 
553 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2739  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.52 
 
 
569 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01137  acyl-CoA synthetase (long-chain-fatty-acid-CoA ligase), acyl-adenylate activating enzyme  34.45 
 
 
550 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00114592  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4074  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.46 
 
 
561 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2428  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.92 
 
 
557 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268357  normal  0.181613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>